More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0796 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5392  leucyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 978 aa  711    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1712  leucyl-tRNA synthetase  58.87 
 
 		 949 aa  1160    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837375  normal  0.849359 
 
 
-
 
NC_002950  PG0796  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 925 aa  1929    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 858 aa  744    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1363  leucyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 		 923 aa  1125    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 833 aa  724    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1254  leucyl-tRNA synthetase  55.01 
 
 		 922 aa  1094    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13250  leucyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 978 aa  705    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1568  leucyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 984 aa  716    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.609969 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04530  leucyl-tRNA synthetase  57.49 
 
 		 944 aa  1126    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12550  leucyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 985 aa  707    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.220072  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2634  leucyl-tRNA synthetase  57.66 
 
 		 969 aa  1146    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0328  leucyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 987 aa  718    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3538  leucyl-tRNA synthetase  58.64 
 
 		 936 aa  1155    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4214  leucyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 952 aa  730    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0565  leucyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 		 954 aa  1080    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352137  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6458  leucyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 854 aa  726    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0952  leucyl-tRNA synthetase  55.64 
 
 		 1146 aa  727    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17360  leucyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 984 aa  686    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634909  normal  0.0124443 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39550  leucyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 949 aa  742    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990256  normal  0.390992 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3901  leucyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 1064 aa  726    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3451  leucyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 952 aa  725    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 954 aa  740    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4914  leucyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 950 aa  744    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.782007 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4829  leucyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 951 aa  731    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.304554  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0671  leucyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 906 aa  795    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0944  leucine--tRNA ligase  39.76 
 
 		 994 aa  689    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1730  leucyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 968 aa  673    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0829  leucyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 1016 aa  713    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10040  leucyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 969 aa  706    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.928861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 971 aa  745    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1287  leucyl-tRNA synthetase  58.79 
 
 		 921 aa  1178    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.242192  normal  0.752482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 971 aa  745    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2223  leucyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 990 aa  706    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 949 aa  734    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3367  leucyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 963 aa  713    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737021  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 805 aa  670    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3733  leucyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 936 aa  784    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0244486  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 833 aa  739    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7074  leucyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 934 aa  749    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6801  leucyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 958 aa  768    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 971 aa  745    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 968 aa  736    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2234  leucyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 982 aa  701    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0120653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2339  leucyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 838 aa  731    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.476002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 857 aa  629  1e-179  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2764  leucyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 		 805 aa  629  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000658086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 802 aa  625  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4875  leucyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 802 aa  617  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 802 aa  617  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 802 aa  617  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4851  leucyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 802 aa  617  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36273  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0386  leucyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 802 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 802 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 802 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0666  leucyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 		 805 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 802 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4861  leucyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 802 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 802 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  43.68 
 
 		 879 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 806 aa  602  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000279205  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 851 aa  590  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0257  leucyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 840 aa  592  1e-167  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.847152  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 		 829 aa  587  1e-166  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0077  leucyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 904 aa  582  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.622899  hitchhiker  0.0000864885 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0551  leucyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 806 aa  579  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4535  leucyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 904 aa  579  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09941  leucyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 		 862 aa  578  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.880556  normal  0.45126 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2055  leucyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 		 853 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 835 aa  576  1.0000000000000001e-163  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 829 aa  570  1e-161  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 865 aa  568  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 804 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2882  leucyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 		 856 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0606181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 805 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  37.51 
 
 		 856 aa  562  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15061  leucyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 		 878 aa  557  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136372 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0659  leucyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 		 804 aa  556  1e-157  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56599  predicted protein  43.92 
 
 		 899 aa  552  1e-156  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0380  leucyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 806 aa  554  1e-156  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 		 859 aa  552  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 		 864 aa  550  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004217  leucyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 		 857 aa  549  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000807673  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 		 865 aa  548  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 		 859 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 		 859 aa  544  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 859 aa  546  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 		 823 aa  546  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1191  leucyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 		 859 aa  545  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.663748 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3702  leucyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 		 859 aa  542  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.031134  hitchhiker  0.000000516313 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2863  leucyl-tRNA synthetase  36.43 
 
 		 859 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 		 819 aa  538  1e-151  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0321  leucyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 862 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.955307  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01672  leucyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 		 867 aa  538  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2929  leucyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 863 aa  538  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.010661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3031  leucyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 		 858 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3311  leucyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 		 874 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134968  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3380  leucyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 		 944 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000107605 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1074  leucyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 		 875 aa  534  1e-150  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.902773 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0232  leucyl-tRNA synthetase  35.32 
 
 		 890 aa  532  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>