More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1287 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 819 aa  692    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2223  leucyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 		 990 aa  684    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0796  leucyl-tRNA synthetase  58.79 
 
 		 925 aa  1167    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17360  leucyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 984 aa  724    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634909  normal  0.0124443 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1568  leucyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 984 aa  728    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.609969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3367  leucyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 963 aa  734    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737021  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 954 aa  732    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0328  leucyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 987 aa  747    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0944  leucine--tRNA ligase  40.18 
 
 		 994 aa  729    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3538  leucyl-tRNA synthetase  62.5 
 
 		 936 aa  1236    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7074  leucyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 934 aa  756    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1730  leucyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 		 968 aa  712    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1254  leucyl-tRNA synthetase  55.68 
 
 		 922 aa  1106    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2339  leucyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 838 aa  756    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.476002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4214  leucyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 952 aa  730    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2634  leucyl-tRNA synthetase  59.07 
 
 		 969 aa  1211    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2234  leucyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 982 aa  723    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0120653 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 835 aa  675    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4829  leucyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 951 aa  747    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.304554  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3451  leucyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 952 aa  725    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12550  leucyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 985 aa  713    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.220072  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1363  leucyl-tRNA synthetase  57.88 
 
 		 923 aa  1181    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10040  leucyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 969 aa  717    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.928861 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3901  leucyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 1064 aa  700    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6801  leucyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 958 aa  745    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0952  leucyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 		 1146 aa  700    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6458  leucyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 854 aa  765    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3733  leucyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 936 aa  785    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0244486  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39550  leucyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 949 aa  744    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990256  normal  0.390992 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 971 aa  754    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04530  leucyl-tRNA synthetase  59.98 
 
 		 944 aa  1191    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1712  leucyl-tRNA synthetase  61.58 
 
 		 949 aa  1252    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837375  normal  0.849359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 971 aa  754    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4914  leucyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 950 aa  750    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.782007 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1287  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 921 aa  1917    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.242192  normal  0.752482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 949 aa  748    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5392  leucyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 978 aa  713    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13250  leucyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 978 aa  711    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0565  leucyl-tRNA synthetase  57.82 
 
 		 954 aa  1128    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 971 aa  754    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0829  leucyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 1016 aa  702    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 968 aa  744    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0671  leucyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 906 aa  626  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 804 aa  622  1e-177  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 858 aa  620  1e-176  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  44.67 
 
 		 879 aa  617  1e-175  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  38.5 
 
 		 872 aa  615  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 		 865 aa  609  1e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 857 aa  609  1e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 833 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1860  leucyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 854 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2882  leucyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 856 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0606181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 		 865 aa  589  1e-167  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0257  leucyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 840 aa  586  1e-166  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.847152  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3031  leucyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 858 aa  588  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 829 aa  587  1e-166  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 805 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 833 aa  584  1.0000000000000001e-165  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  35.18 
 
 		 851 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 805 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0425  leucyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 801 aa  575  1.0000000000000001e-162  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0736  leucyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 		 865 aa  570  1e-161  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0665  leucyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 807 aa  572  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1033  leucyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 875 aa  568  1e-160  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2055  leucyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 853 aa  566  1e-160  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 		 859 aa  559  1e-158  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09941  leucyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 		 862 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.880556  normal  0.45126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0077  leucyl-tRNA synthetase  35.72 
 
 		 904 aa  557  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.622899  hitchhiker  0.0000864885 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 805 aa  546  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 		 856 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4535  leucyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 904 aa  544  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1074  leucyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 		 875 aa  545  1e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.902773 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 		 864 aa  541  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2344  leucyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 		 856 aa  538  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.633045  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 		 824 aa  536  1e-151  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 		 824 aa  537  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0659  leucyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 804 aa  535  1e-150  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 		 824 aa  527  1e-148  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09721  leucyl-tRNA synthetase  36.6 
 
 		 856 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.90709  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0321  leucyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 		 862 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.955307  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0432  leucyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 		 859 aa  520  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0302206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1106  leucyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 		 884 aa  516  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15061  leucyl-tRNA synthetase  33.16 
 
 		 878 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136372 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1446  leucyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 		 894 aa  515  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.943186 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0380  leucyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 806 aa  514  1e-144  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09711  leucyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 		 864 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.217305  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0751  leucyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 		 860 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0691  leucyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 		 860 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.229457  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0808  leucyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 		 860 aa  509  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 		 856 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09701  leucyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 		 856 aa  508  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1704  leucyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 929 aa  508  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0764  leucyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 		 860 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.544549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0705  leucyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 		 860 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0911  leucyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 856 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168509  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2132  leucyl-tRNA synthetase  34.6 
 
 		 863 aa  504  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.142112 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1309  leucyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 		 879 aa  503  1e-141  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 804 aa  505  1e-141  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0349  leucyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 		 865 aa  502  1e-140  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1376  leucyl-tRNA synthetase  34.2 
 
 		 879 aa  501  1e-140  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.264613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>