More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1568 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2234  leucyl-tRNA synthetase  70.23 
 
 		 982 aa  1394    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0120653 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3538  leucyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 936 aa  730    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7074  leucyl-tRNA synthetase  60.18 
 
 		 934 aa  1149    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0796  leucyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 925 aa  704    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 804 aa  731    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  61.48 
 
 		 954 aa  1182    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  42.87 
 
 		 802 aa  740    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4875  leucyl-tRNA synthetase  42.87 
 
 		 802 aa  740    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0829  leucyl-tRNA synthetase  54.46 
 
 		 1016 aa  1041    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0386  leucyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 802 aa  737    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0671  leucyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 		 906 aa  792    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 802 aa  743    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 802 aa  743    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 802 aa  743    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  58.97 
 
 		 949 aa  1113    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4214  leucyl-tRNA synthetase  58.98 
 
 		 952 aa  1106    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12550  leucyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 985 aa  1165    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.220072  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0565  leucyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 954 aa  711    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352137  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  57.81 
 
 		 971 aa  1105    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1363  leucyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 923 aa  723    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0425  leucyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 801 aa  660    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1254  leucyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 922 aa  735    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4829  leucyl-tRNA synthetase  58.09 
 
 		 951 aa  1064    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.304554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 802 aa  746    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 802 aa  743    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10040  leucyl-tRNA synthetase  57.24 
 
 		 969 aa  1051    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.928861 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4914  leucyl-tRNA synthetase  61.32 
 
 		 950 aa  1181    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.782007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3901  leucyl-tRNA synthetase  53.56 
 
 		 1064 aa  1049    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4851  leucyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 802 aa  744    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36273  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1568  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 984 aa  2023    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.609969 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 802 aa  750    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 857 aa  806    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04530  leucyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 944 aa  724    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0328  leucyl-tRNA synthetase  62.04 
 
 		 987 aa  1260    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4861  leucyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 802 aa  743    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  57.81 
 
 		 971 aa  1105    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5392  leucyl-tRNA synthetase  57.33 
 
 		 978 aa  1115    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0665  leucyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 807 aa  701    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1287  leucyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 921 aa  728    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.242192  normal  0.752482 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13250  leucyl-tRNA synthetase  72.13 
 
 		 978 aa  1447    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3367  leucyl-tRNA synthetase  59.84 
 
 		 963 aa  1160    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737021  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3868  leucyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 857 aa  682    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2223  leucyl-tRNA synthetase  67.75 
 
 		 990 aa  1318    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 806 aa  687    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000279205  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1730  leucyl-tRNA synthetase  65.3 
 
 		 968 aa  1306    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3451  leucyl-tRNA synthetase  61.78 
 
 		 952 aa  1176    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3733  leucyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 936 aa  807    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0244486  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 804 aa  675    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0944  leucine--tRNA ligase  60.45 
 
 		 994 aa  1222    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6801  leucyl-tRNA synthetase  58.69 
 
 		 958 aa  1172    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2764  leucyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 805 aa  729    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000658086  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1712  leucyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 949 aa  719    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837375  normal  0.849359 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2634  leucyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 		 969 aa  709    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  57.81 
 
 		 971 aa  1105    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39550  leucyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 		 949 aa  1165    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990256  normal  0.390992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  57.94 
 
 		 968 aa  1116    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0666  leucyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 		 805 aa  651    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17360  leucyl-tRNA synthetase  60.73 
 
 		 984 aa  1187    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634909  normal  0.0124443 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 833 aa  634  1e-180  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 833 aa  629  1e-179  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2339  leucyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 838 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.476002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  44.49 
 
 		 879 aa  625  1e-178  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6458  leucyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 854 aa  625  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 858 aa  615  9.999999999999999e-175  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 808 aa  608  9.999999999999999e-173  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 835 aa  597  1e-169  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 		 830 aa  590  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 805 aa  591  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 805 aa  591  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 		 824 aa  588  1e-166  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 824 aa  587  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0551  leucyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 806 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 805 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 829 aa  582  1.0000000000000001e-165  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56599  predicted protein  37.3 
 
 		 899 aa  585  1.0000000000000001e-165  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 865 aa  580  1e-164  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 		 824 aa  582  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 		 856 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1009  leucyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 816 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2882  leucyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 856 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0606181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 		 824 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0380  leucyl-tRNA synthetase  34.13 
 
 		 806 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 		 810 aa  569  1e-161  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1860  leucyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 		 854 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4419  leucyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 814 aa  567  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 		 817 aa  566  1e-160  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3031  leucyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 		 858 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 805 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 805 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0659  leucyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 		 804 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0257  leucyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 840 aa  563  1.0000000000000001e-159  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.847152  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0567  leucyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 819 aa  559  1e-158  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0791746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1254  leucyl-tRNA synthetase  34.78 
 
 		 817 aa  560  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.702652  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 		 826 aa  557  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2829  leucyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 819 aa  557  1e-157  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 		 813 aa  553  1e-156  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0505  leucyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 806 aa  553  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 		 823 aa  555  1e-156  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 		 819 aa  549  1e-155  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15061  leucyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 878 aa  552  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>