More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4914 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2234  leucyl-tRNA synthetase  61.52 
 
 
982 aa  1194    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0120653 
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
819 aa  681    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04530  leucyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 
944 aa  775    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0425  leucyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 
801 aa  647    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0796  leucyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
925 aa  737    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
858 aa  784    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 
804 aa  773    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
802 aa  778    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 
833 aa  789    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 
802 aa  776    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 
802 aa  776    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 
802 aa  776    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0551  leucyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 
806 aa  684    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4861  leucyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 
802 aa  776    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3733  leucyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 
936 aa  830    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0244486  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  63.17 
 
 
971 aa  1222    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  46.24 
 
 
879 aa  645    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1712  leucyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
949 aa  765    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837375  normal  0.849359 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0257  leucyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 
840 aa  741    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.847152  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13250  leucyl-tRNA synthetase  64.03 
 
 
978 aa  1202    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 
802 aa  773    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
805 aa  687    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0386  leucyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
802 aa  775    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 
805 aa  668    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56599  predicted protein  43.69 
 
 
899 aa  714    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1254  leucyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
922 aa  784    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
805 aa  693    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 
802 aa  776    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4914  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
950 aa  1951    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.782007 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0659  leucyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 
804 aa  636    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 
805 aa  726    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3538  leucyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 
936 aa  772    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3901  leucyl-tRNA synthetase  54.67 
 
 
1064 aa  1069    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3367  leucyl-tRNA synthetase  63.93 
 
 
963 aa  1217    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737021  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1363  leucyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
923 aa  767    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4851  leucyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
802 aa  778    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36273  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6458  leucyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 
854 aa  760    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
802 aa  781    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1730  leucyl-tRNA synthetase  62.72 
 
 
968 aa  1217    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39550  leucyl-tRNA synthetase  65.41 
 
 
949 aa  1273    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990256  normal  0.390992 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0938  leucyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 
807 aa  647    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 
805 aa  726    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0944  leucine--tRNA ligase  55.85 
 
 
994 aa  1076    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0665  leucyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
807 aa  699    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0666  leucyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 
805 aa  795    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  69.61 
 
 
954 aa  1367    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10040  leucyl-tRNA synthetase  60.27 
 
 
969 aa  1140    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.928861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  63.17 
 
 
971 aa  1222    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0671  leucyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 
906 aa  852    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17360  leucyl-tRNA synthetase  62.24 
 
 
984 aa  1180    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634909  normal  0.0124443 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 
857 aa  804    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1287  leucyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
921 aa  754    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.242192  normal  0.752482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0565  leucyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 
954 aa  742    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352137  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7074  leucyl-tRNA synthetase  64.94 
 
 
934 aa  1269    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4829  leucyl-tRNA synthetase  60.76 
 
 
951 aa  1141    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.304554  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0505  leucyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
806 aa  682    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3451  leucyl-tRNA synthetase  69.8 
 
 
952 aa  1355    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12550  leucyl-tRNA synthetase  57.46 
 
 
985 aa  1100    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.220072  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4214  leucyl-tRNA synthetase  61.91 
 
 
952 aa  1163    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0829  leucyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 
1016 aa  1092    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 
829 aa  761    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 
829 aa  717    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 
804 aa  716    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 
808 aa  763    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 
833 aa  800    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2339  leucyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
838 aa  816    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.476002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  44 
 
 
835 aa  761    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3868  leucyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 
857 aa  702    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4875  leucyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
802 aa  778    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5392  leucyl-tRNA synthetase  62.09 
 
 
978 aa  1204    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2634  leucyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
969 aa  757    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0551  leucyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 
816 aa  679    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  63.75 
 
 
949 aa  1199    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2764  leucyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 
805 aa  789    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000658086  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2223  leucyl-tRNA synthetase  62.05 
 
 
990 aa  1145    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  63.17 
 
 
971 aa  1222    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 
806 aa  721    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000279205  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  63.69 
 
 
968 aa  1217    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0328  leucyl-tRNA synthetase  55.62 
 
 
987 aa  1089    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1568  leucyl-tRNA synthetase  61.32 
 
 
984 aa  1193    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.609969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6801  leucyl-tRNA synthetase  61.32 
 
 
958 aa  1170    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1009  leucyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
816 aa  626  1e-178  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4419  leucyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 
814 aa  622  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0380  leucyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 
806 aa  623  1e-177  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl490  leucyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
801 aa  622  1e-176  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 
816 aa  618  1e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1033  leucyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
875 aa  610  1e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 
824 aa  609  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 
830 aa  610  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 
824 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1197  leucyl-tRNA synthetase  37.06 
 
 
800 aa  608  9.999999999999999e-173  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000558388  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 
829 aa  607  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 
813 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 
810 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 
823 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_182  leucyl-tRNA synthetase  37.81 
 
 
813 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00206077  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0657  leucyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 
816 aa  599  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 
824 aa  600  1e-170  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3454  leucyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 
814 aa  598  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1254  leucyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
817 aa  596  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.702652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>