More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3538 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5392  leucyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 978 aa  742    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 819 aa  725    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4829  leucyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 951 aa  740    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.304554  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3451  leucyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 952 aa  753    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_002950  PG0796  leucyl-tRNA synthetase  58.64 
 
 		 925 aa  1144    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 858 aa  660    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6801  leucyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 958 aa  741    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 833 aa  702    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1730  leucyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 968 aa  701    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2234  leucyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 982 aa  723    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0120653 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3538  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 936 aa  1944    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4214  leucyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 952 aa  724    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04530  leucyl-tRNA synthetase  59.67 
 
 		 944 aa  1165    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0671  leucyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 906 aa  771    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 835 aa  687    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0952  leucyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 		 1146 aa  727    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4914  leucyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 950 aa  765    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.782007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10040  leucyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 969 aa  738    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.928861 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0565  leucyl-tRNA synthetase  57.95 
 
 		 954 aa  1129    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352137  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3733  leucyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 936 aa  803    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0244486  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7074  leucyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 934 aa  788    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0944  leucine--tRNA ligase  41.18 
 
 		 994 aa  727    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 949 aa  754    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3901  leucyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 1064 aa  696    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1363  leucyl-tRNA synthetase  56 
 
 		 923 aa  1142    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 954 aa  765    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2223  leucyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 990 aa  708    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6458  leucyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 854 aa  703    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3367  leucyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 963 aa  748    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737021  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2634  leucyl-tRNA synthetase  64.6 
 
 		 969 aa  1298    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1712  leucyl-tRNA synthetase  67.79 
 
 		 949 aa  1360    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837375  normal  0.849359 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 857 aa  636    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 971 aa  746    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1254  leucyl-tRNA synthetase  56.24 
 
 		 922 aa  1094    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1287  leucyl-tRNA synthetase  62.5 
 
 		 921 aa  1236    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.242192  normal  0.752482 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13250  leucyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 978 aa  705    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12550  leucyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 985 aa  692    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.220072  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39550  leucyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 949 aa  743    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990256  normal  0.390992 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2339  leucyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 838 aa  749    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.476002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 971 aa  746    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0829  leucyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 1016 aa  713    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17360  leucyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 984 aa  731    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634909  normal  0.0124443 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 833 aa  640    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1568  leucyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 984 aa  730    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.609969 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 971 aa  746    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 968 aa  744    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0328  leucyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 987 aa  727    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2764  leucyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 		 805 aa  623  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000658086  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0666  leucyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 805 aa  617  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 856 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 802 aa  610  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2882  leucyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 856 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0606181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4875  leucyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 802 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 806 aa  610  1e-173  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000279205  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 802 aa  611  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 829 aa  611  1e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 802 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 802 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 802 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4861  leucyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 802 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 802 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 802 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4851  leucyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 802 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36273  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0386  leucyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 802 aa  601  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  42.67 
 
 		 879 aa  601  1e-170  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0257  leucyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 840 aa  597  1e-169  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.847152  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 		 872 aa  592  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 804 aa  590  1e-167  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0425  leucyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 		 801 aa  585  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 		 851 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0551  leucyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 806 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 859 aa  572  1e-161  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 865 aa  572  1e-161  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 805 aa  570  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1566  leucyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 		 870 aa  568  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.408978  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0321  leucyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 		 862 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.955307  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3031  leucyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 		 858 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 804 aa  565  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4535  leucyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 		 904 aa  561  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0511  leucyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 		 866 aa  562  1e-158  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0077  leucyl-tRNA synthetase  36.35 
 
 		 904 aa  562  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.622899  hitchhiker  0.0000864885 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0665  leucyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 807 aa  562  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01672  leucyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 		 867 aa  561  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  35.99 
 
 		 865 aa  558  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0380  leucyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 806 aa  558  1e-157  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0505  leucyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 806 aa  559  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 805 aa  554  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 805 aa  554  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 805 aa  551  1e-155  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 805 aa  552  1e-155  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2344  leucyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 		 856 aa  550  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.633045  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1860  leucyl-tRNA synthetase  36.18 
 
 		 854 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3868  leucyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 857 aa  546  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1033  leucyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 875 aa  546  1e-154  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1191  leucyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 		 859 aa  548  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.663748 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1074  leucyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 		 875 aa  544  1e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.902773 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 		 864 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 		 864 aa  542  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09941  leucyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 862 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.880556  normal  0.45126 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1722  leucyl-tRNA synthetase  35.18 
 
 		 863 aa  536  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>