More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3733 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0551  leucyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 
806 aa  834    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0665  leucyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
807 aa  802    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 
819 aa  791    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 
813 aa  644    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 
824 aa  640    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1207  leucyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
860 aa  651    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.338789  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0796  leucyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 
925 aa  782    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 
858 aa  897    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 
804 aa  889    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 
828 aa  646    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0478  leucyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
894 aa  654    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 
802 aa  892    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1722  leucyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 
863 aa  655    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 
833 aa  907    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 
971 aa  825    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
859 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01222  leucyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 
862 aa  659    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 
802 aa  894    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 
802 aa  893    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl490  leucyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 
801 aa  649    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 
802 aa  894    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 
824 aa  644    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1363  leucyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 
923 aa  827    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3015  leucyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 
860 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.652989  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3311  leucyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
874 aa  649    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134968  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 
835 aa  823    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 
949 aa  818    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0938  leucyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
807 aa  766    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1842  leucyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 
860 aa  641    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 
872 aa  660    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
823 aa  669    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
819 aa  661    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 
954 aa  847    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 
851 aa  660    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3702  leucyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 
859 aa  645    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.031134  hitchhiker  0.000000516313 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 
805 aa  818    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 
805 aa  777    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0565  leucyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
954 aa  761    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352137  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0328  leucyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 
987 aa  781    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3868  leucyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
857 aa  784    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 
802 aa  894    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2926  leucyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 
860 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.454668  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
865 aa  689    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf171  leucyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 
804 aa  684    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0659  leucyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 
804 aa  643    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
802 aa  884    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
829 aa  640    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2863  leucyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 
859 aa  645    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0505  leucyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 
806 aa  796    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3901  leucyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 
1064 aa  812    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
805 aa  854    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
805 aa  854    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10040  leucyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 
969 aa  815    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.928861 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
865 aa  653    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2929  leucyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
863 aa  641    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.010661 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4535  leucyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
904 aa  692    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0077  leucyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
904 aa  695    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.622899  hitchhiker  0.0000864885 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0797  leucyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 
872 aa  640    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.749816  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  52.55 
 
 
879 aa  746    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
824 aa  662    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 
857 aa  916    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 
806 aa  811    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000279205  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 
859 aa  647    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 
805 aa  776    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 
971 aa  825    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
817 aa  659    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1566  leucyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 
870 aa  664    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.408978  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0829  leucyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
1016 aa  807    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1287  leucyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
921 aa  791    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.242192  normal  0.752482 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0657  leucyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
816 aa  649    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 
816 aa  663    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1557  leucyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 
860 aa  640    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
824 aa  655    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
859 aa  645    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
859 aa  647    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3451  leucyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
952 aa  833    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0705  leucyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 
872 aa  636    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 
824 aa  688    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0705  leucyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 
860 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  49.95 
 
 
829 aa  853    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
829 aa  834    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 
804 aa  820    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 
808 aa  840    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 
833 aa  903    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4419  leucyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 
814 aa  672    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
859 aa  647    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 
819 aa  644    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3143  leucyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 
868 aa  636    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606298  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0551  leucyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 
816 aa  805    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
864 aa  649    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 
971 aa  825    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1191  leucyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
859 aa  655    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.663748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 
968 aa  823    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 
864 aa  655    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 
829 aa  649    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3269  leucyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
874 aa  645    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 
813 aa  637    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 
802 aa  898    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0255  leucyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
816 aa  648    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00083346  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3447  leucyl-tRNA synthetase  40 
 
 
874 aa  645    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>