More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6318 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
429 aa  870    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3673  6-phosphogluconolactonase  64.66 
 
 
242 aa  292  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1889  6-phosphogluconolactonase  59.92 
 
 
248 aa  279  7e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2644  6-phosphogluconolactonase  63.64 
 
 
251 aa  276  7e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3477  6-phosphogluconolactonase  58.68 
 
 
248 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3272  6-phosphogluconolactonase  63.18 
 
 
235 aa  272  7e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4158  6-phosphogluconolactonase  59.92 
 
 
246 aa  269  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105451  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3674  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  67.88 
 
 
180 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4159  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  68.1 
 
 
182 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134532  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2308  6-phosphogluconolactonase  54.11 
 
 
241 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0267675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4827  6-phosphogluconolactonase  51.49 
 
 
243 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179164 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7448  6-phosphogluconolactonase  57.4 
 
 
240 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.526789  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5294  6-phosphogluconolactonase  51.49 
 
 
243 aa  219  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5372  6-phosphogluconolactonase  54.37 
 
 
243 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.364101 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1888  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  65.62 
 
 
178 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0855471  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3478  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  64.33 
 
 
167 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6709  6-phosphogluconolactonase  53.02 
 
 
239 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3273  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  60.61 
 
 
178 aa  200  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2645  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  56.17 
 
 
172 aa  186  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0456  6-phosphogluconolactonase  47.75 
 
 
241 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.52308  normal  0.121254 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2354  6-phosphogluconolactonase  43.51 
 
 
245 aa  173  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3661  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  53.33 
 
 
190 aa  172  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.215078  normal  0.274585 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0840  gluconokinase  51.9 
 
 
181 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3463  carbohydrate kinase  53.33 
 
 
180 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3770  carbohydrate kinase  53.7 
 
 
188 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1794  6-phosphogluconolactonase  47.12 
 
 
240 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3771  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  53.33 
 
 
180 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0625  carbohydrate kinase  52.8 
 
 
166 aa  170  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.207561  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2814  6-phosphogluconolactonase  41.83 
 
 
252 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2932  carbohydrate kinase  53.37 
 
 
167 aa  169  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6828  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50 
 
 
207 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0830  carbohydrate kinase  52.83 
 
 
156 aa  167  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0395  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  52.56 
 
 
179 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.104744 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0786  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  49.4 
 
 
178 aa  162  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.494269  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5911  carbohydrate kinase  52.87 
 
 
169 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5034  gluconokinase  50.93 
 
 
167 aa  159  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3525  gluconate kinase  48.39 
 
 
184 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263705  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0242  gluconate kinase  48.47 
 
 
161 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1273  6-phosphogluconolactonase  41.42 
 
 
245 aa  157  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169583  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0365  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50 
 
 
176 aa  157  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24180  gluconate kinase  52.5 
 
 
174 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.0373923 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0427  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.78 
 
 
178 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133894 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0266  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.34 
 
 
175 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0596402  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0502  carbohydrate kinase  49.07 
 
 
170 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0162  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.8 
 
 
181 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4788  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  53.79 
 
 
200 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2720  carbohydrate kinase  47.56 
 
 
167 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2124  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.32 
 
 
174 aa  154  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3878  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.3 
 
 
180 aa  154  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.689499  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5328  gluconate kinase  48.45 
 
 
171 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5707  gluconate kinase  48.45 
 
 
171 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.787187  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001959  gluconokinase  47.1 
 
 
174 aa  154  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3528  gluconate kinase  46.06 
 
 
181 aa  154  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5417  gluconate kinase  48.45 
 
 
171 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0666  thermosensitive gluconokinase  45.81 
 
 
174 aa  153  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.337955  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00513  gluconate kinase  45.51 
 
 
173 aa  153  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4512  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  49.37 
 
 
185 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3749  gluconate kinase  46.95 
 
 
167 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1455  6-phosphogluconolactonase  40.34 
 
 
236 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1481  6-phosphogluconolactonase  40.34 
 
 
236 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.448023  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0180  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  46.34 
 
 
167 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  49.03 
 
 
779 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0663  carbohydrate kinase  46.34 
 
 
167 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0555  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.77 
 
 
167 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0592  gluconate kinase  47.83 
 
 
165 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0558  carbohydrate kinase  46.34 
 
 
167 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0584  carbohydrate kinase  46.34 
 
 
167 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170664  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3722  gluconate kinase  53.46 
 
 
160 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0630  carbohydrate kinase  47.56 
 
 
167 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4889  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.85 
 
 
173 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6413  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.17 
 
 
185 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00235044  normal  0.475795 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2577  carbohydrate kinase  49.68 
 
 
164 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313966 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2408  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.37 
 
 
176 aa  150  5e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.949742  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3367  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.83 
 
 
165 aa  150  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.000000649904 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3252  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.27 
 
 
208 aa  150  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.507314  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4571  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.25 
 
 
163 aa  150  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.992744  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4056  carbohydrate kinase  43.9 
 
 
191 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1220  thermoresistant gluconokinase  46.88 
 
 
173 aa  150  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.68 
 
 
759 aa  150  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4087  carbohydrate kinase  43.9 
 
 
191 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4174  carbohydrate kinase  43.9 
 
 
191 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0332  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.83 
 
 
169 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3436  carbohydrate kinase  48.72 
 
 
166 aa  149  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3978  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.29 
 
 
186 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1801  thermosensitive gluconokinase  46.95 
 
 
178 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.688774  normal  0.112743 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3198  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  49.38 
 
 
166 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000236698 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1575  carbohydrate kinase  46.95 
 
 
178 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.157856  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0317  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.83 
 
 
169 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.638747  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2443  thermoresistant gluconokinase  48.45 
 
 
172 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3439  shikimate kinase  48.45 
 
 
171 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1217  thermoresistant gluconokinase  48.45 
 
 
172 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3437  putative thermoresistant gluconokinase  48.45 
 
 
172 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3403  putative thermoresistant gluconokinase  48.45 
 
 
172 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2628  thermoresistant gluconokinase  48.45 
 
 
172 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0043609  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2932  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family protein  45.45 
 
 
174 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.716161  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0359  thermoresistant gluconokinase  48.45 
 
 
172 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4531  carbohydrate kinase  44.24 
 
 
178 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2114  gluconate kinase  47.13 
 
 
170 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2732  gluconate kinase  44.72 
 
 
170 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689831  normal  0.094842 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2665  thermoresistant gluconokinase  42.59 
 
 
171 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>