More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5877 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5877  FUR family transcriptional regulator  100 
 
 		 164 aa  339  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.200275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0071  ferric uptake regulator family protein  44.23 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0493  ferric uptake regulator, Fur family  45.4 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2230  ferric uptake regulator family protein  51.18 
 
 		 164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0381  ferric uptake regulator, Fur family  51.18 
 
 		 164 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2686  ferric uptake regulator family protein  48 
 
 		 171 aa  136  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0219  ferric-uptake regulator  43.45 
 
 		 162 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0614  ferric uptake regulator family protein  43.45 
 
 		 162 aa  133  9e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0043  ferric uptake regulator family protein  43.15 
 
 		 165 aa  133  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0035  ferric-uptake regulator  43.15 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.232993 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2583  ferric uptake regulator, Fur family  49.61 
 
 		 163 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0134426  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3916  ferric uptake regulator family protein  47.01 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3179  ferric-uptake regulator  47.01 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3940  ferric uptake regulator family protein  47.24 
 
 		 136 aa  129  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648829  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0350  ferric uptake regulator family protein  42.36 
 
 		 164 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0364  FUR family transcriptional regulator  44.96 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3788  ferric uptake regulator family protein  50 
 
 		 137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0428  ferric uptake regulator, Fur family  41.38 
 
 		 149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3937  hypothetical protein  44.3 
 
 		 146 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.303418  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3451  ferric uptake regulator family protein  43.41 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0380  FUR family transcriptional regulator  44.96 
 
 		 195 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3651  ferric uptake regulator, Fur family  51.61 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0423  ferric-uptake regulator  45.4 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.25434 
 
 
-
 
NC_004310  BR2174  ferric uptake regulator family protein  45.45 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0456  ferric uptake regulator, Fur family  45.4 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.190057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4376  ferric uptake regulator, Fur family  45.38 
 
 		 139 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.217188 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1011  ferric uptake regulator  44.7 
 
 		 138 aa  123  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2086  ferric uptake regulator family protein  45.45 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.941091  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4055  ferric uptake regulator, Fur family  45.38 
 
 		 139 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3637  ferric uptake regulator family protein  49.6 
 
 		 143 aa  123  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386117 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0310  ferric uptake regulator family protein  47.62 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0738  ferric uptake regulator family protein  43.18 
 
 		 145 aa  120  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0183  ferric uptake regulator family protein  46.83 
 
 		 142 aa  120  9e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0183  transcriptional regulator Fur family  42.64 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1267  iron response regulator Irr  44.36 
 
 		 147 aa  120  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3845  ferric uptake regulator family protein  48.7 
 
 		 208 aa  117  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2346  ferric uptake regulator, Fur family  44.72 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.766675 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0977  ferric uptake regulator family protein  45.86 
 
 		 147 aa  114  7.999999999999999e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.053253  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1652  ferric uptake regulator family protein  41.78 
 
 		 174 aa  113  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0785232  normal  0.738354 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1272  ferric uptake regulator, Fur family  41.6 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3691  ferric uptake regulator, Fur family  50.42 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3233  ferric uptake regulator family protein  42.06 
 
 		 139 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0491  ferric uptake regulator family protein  45.95 
 
 		 161 aa  100  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.781882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1714  ferric uptake regulator family protein  40 
 
 		 136 aa  91.7  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.382705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2466  ferric uptake regulator, Fur family  38.1 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1623  ferric uptake regulator, Fur family  35.88 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.507578  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3521  ferric uptake regulator, Fur family  34.11 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1955  transcriptional regulator, Fur family  36.22 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  32.5 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  41.49 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  41.49 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0844  ferric uptake regulator, Fur family  36.46 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126283  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  33.9 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  36.45 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2798  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  32.58 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.1309500000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  34.29 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  31.03 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  30.89 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  35.05 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  34.58 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  34.58 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  34.58 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0208  ferric uptake regulator family protein  26.77 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0458  ferric uptake regulator, Fur family  33.72 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485327 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  35.05 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  35.05 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0282  ferric uptake regulation protein  33.72 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  35.05 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  35.05 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0615  ferric uptake regulator, Fur family  33.66 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.12884  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  37.5 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  31.96 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  27.13 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  30.08 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3627  ferric uptake regulator family protein  27.01 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  35.71 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43000  Ferric-uptake regulator, fur  27.13 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4167  ferric uptake regulator family protein  32.12 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01084  ferric uptake regulator  35 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00618384  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0486  ferric uptake regulator, Fur family  36.26 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.53591  normal  0.162007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  31.71 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.231223 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  30.93 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1594  ferric uptake regulator, Fur family  26.92 
 
 		 135 aa  53.9  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  30.93 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  36.56 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  30.93 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  25.19 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  30.93 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  30.93 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  30.93 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2723  ferric uptake regulation protein  28.91 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.259626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  30.93 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  34.15 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63020  ferric uptake regulation protein  26.56 
 
 		 134 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  30.93 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  32.65 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>