287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4802 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4802  putative (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase (ACP phosphodiesterase)  100 
 
 		 208 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0105  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  39.61 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1236  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.9 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0754  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.41 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665769  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0699  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.19 
 
 		 209 aa  121  8e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4826  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.08 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294925  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6529  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152148 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7470  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  35.33 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6039  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.36 
 
 		 210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126863 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5675  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.36 
 
 		 210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2250  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.84 
 
 		 210 aa  114  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.488549  normal  0.224551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5382  acyl carrier protein phosphodiesterase, putative  35.23 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1846  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.83 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0747958  normal  0.1639 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3438  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.64 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1788  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.27 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4071  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.07 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.184072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3958  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.07 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.506419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1488  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.75 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.385532 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3273  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.33 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2656  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.84 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.129409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.01 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1642  azoreductase  29.77 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000115875  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.84 
 
 		 198 aa  91.3  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.84 
 
 		 198 aa  91.3  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3398  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.5 
 
 		 196 aa  91.7  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.27302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.84 
 
 		 237 aa  91.3  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.84 
 
 		 237 aa  91.3  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.84 
 
 		 237 aa  91.3  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.84 
 
 		 237 aa  91.3  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.84 
 
 		 237 aa  91.3  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2064  azoreductase  28.97 
 
 		 211 aa  90.5  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000203481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2351  azoreductase  29.44 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.51 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.51 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  37.04 
 
 		 202 aa  90.5  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  36.53 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  35.93 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3492  azoreductase  26.76 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0334  azoreductase  31.22 
 
 		 197 aa  90.5  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429101  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1427  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.52 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.28 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2222  azoreductase  29.44 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000166234  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.28 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2023  azoreductase  28.97 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000234094  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0023  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.09 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00721211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2707  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.94 
 
 		 200 aa  88.2  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4073  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.1 
 
 		 202 aa  88.2  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.26 
 
 		 208 aa  88.6  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.26 
 
 		 208 aa  88.6  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.27 
 
 		 198 aa  88.2  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3529  azoreductase  32.58 
 
 		 197 aa  88.2  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  32.95 
 
 		 201 aa  88.2  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  32.95 
 
 		 201 aa  88.2  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  32.95 
 
 		 201 aa  88.2  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2269  azoreductase  28.5 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000607817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2085  azoreductase  28.5 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000156385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2239  azoreductase  28.5 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.84 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.27 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  32.14 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  32.65 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2025  azoreductase  28.5 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.08402e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.11 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  32.69 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  34.38 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2266  azoreductase  28.5 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42446e-33 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  32.26 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.45 
 
 		 198 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.45 
 
 		 198 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.45 
 
 		 198 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1242  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.33 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0937956 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.75 
 
 		 201 aa  85.9  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.91 
 
 		 198 aa  85.9  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3102  azoreductase  28.5 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.0000000000000239048 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.02 
 
 		 199 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6485  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.75 
 
 		 201 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01015  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  30.36 
 
 		 200 aa  85.1  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000114134  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3478  azoreductase  32.4 
 
 		 197 aa  85.1  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.53 
 
 		 199 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4734  acyl carrier protein phosphodiesterase  33.18 
 
 		 212 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  32.21 
 
 		 201 aa  85.1  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54120  acyl carrier protein phosphodiesterase  31.43 
 
 		 212 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  31.91 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0871  acyl carrier protein phosphodiesterase 3; NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.91 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.199319  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.22 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1271  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.63 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.78 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  32 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0307  azoreductase  31.11 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000628195  hitchhiker  0.0000000950602 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0354  FMN-dependent NADH-azoreductase 1  41.96 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0569  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.78 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3076  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.64 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  32 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  32 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  32 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  32 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.69 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.38 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  32 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>