286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5382 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5382  acyl carrier protein phosphodiesterase, putative  100 
 
 
209 aa  427  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0105  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  46.31 
 
 
222 aa  187  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6039  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  42.55 
 
 
210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126863 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5675  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.55 
 
 
210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6529  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.32 
 
 
210 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.152148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4826  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.4 
 
 
210 aa  158  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294925  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7470  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  38.54 
 
 
210 aa  157  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0754  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.28 
 
 
207 aa  141  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665769  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0699  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  38.42 
 
 
209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2250  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.44 
 
 
210 aa  131  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.488549  normal  0.224551 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1236  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.96 
 
 
210 aa  121  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1846  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.59 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0747958  normal  0.1639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4802  putative (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase (ACP phosphodiesterase)  35.23 
 
 
208 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.33 
 
 
213 aa  96.3  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.83 
 
 
201 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.6 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.6 
 
 
216 aa  95.1  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.6 
 
 
216 aa  94.7  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  33.66 
 
 
199 aa  94.7  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1788  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.23 
 
 
208 aa  94  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4396  azoreductase  35.09 
 
 
198 aa  93.2  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  35.58 
 
 
198 aa  91.3  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3728  putative acyl carrier protein phosphodiesterase  32.96 
 
 
196 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3461  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.96 
 
 
196 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1442  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.08 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
199 aa  90.5  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3430  azoreductase  27.88 
 
 
230 aa  89  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000541097  hitchhiker  0.0000000234591 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.73 
 
 
212 aa  89.4  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1914  azoreductase  27.88 
 
 
230 aa  89  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000230252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1993  azoreductase  27.88 
 
 
208 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000776561  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3492  azoreductase  30.29 
 
 
212 aa  88.2  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1750  azoreductase  27.88 
 
 
208 aa  88.2  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24715e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1728  azoreductase  27.88 
 
 
208 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0202  azoreductase  28.29 
 
 
208 aa  88.2  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0196  azoreductase  28.29 
 
 
208 aa  88.2  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0203281  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01015  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.65 
 
 
200 aa  88.2  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000114134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1944  azoreductase  27.88 
 
 
230 aa  88.2  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4960600000000002e-30 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.18 
 
 
201 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1770  azoreductase  27.88 
 
 
230 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000243182  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.13 
 
 
198 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.05 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.635912  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.13 
 
 
198 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  33.33 
 
 
237 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1908  azoreductase  27.88 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351554  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  33.33 
 
 
237 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0290  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.84 
 
 
223 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  33.33 
 
 
237 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.18 
 
 
201 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.26 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  33.33 
 
 
237 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6485  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.16 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  33.33 
 
 
237 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.67 
 
 
214 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.67 
 
 
214 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  34.95 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0316  azoreductase  33.74 
 
 
198 aa  85.5  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001628  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.65 
 
 
202 aa  85.1  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.41 
 
 
201 aa  84.7  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226705  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
208 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.7 
 
 
199 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  30.1 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.02 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
208 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  30.11 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  29.41 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.97 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0321  azoreductase  33.74 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000292706  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3703  azoreductase  33.74 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000384963  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.18 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.64 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.27 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5204  azoreductase  27.32 
 
 
208 aa  82  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.83 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5107  azoreductase  26.96 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0384145  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.35 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.67 
 
 
198 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2085  azoreductase  28.91 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000156385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2239  azoreductase  28.91 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02502  azoreductase  32.22 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5590  azoreductase  26.83 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.53 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5262  azoreductase  26.96 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000325638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2025  azoreductase  28.91 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.08402e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5090  azoreductase  26.96 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2266  azoreductase  28.91 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42446e-33 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5660  azoreductase  26.96 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.883174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5505  azoreductase  26.96 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1772  azoreductase  25.48 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000156707  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  34.24 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0320  azoreductase  31.98 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000159762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0325  azoreductase  31.98 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0423  azoreductase  32.52 
 
 
198 aa  79  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1590  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.48 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00209131  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.35 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1242  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.35 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0937956 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.8 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0324  azoreductase  31.98 
 
 
198 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00233774  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2351  azoreductase  29.38 
 
 
211 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2023  azoreductase  29.38 
 
 
211 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000234094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>