More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3301 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  100 
 
 		 259 aa  518  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  78.35 
 
 		 260 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  71.32 
 
 		 257 aa  374  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  74.06 
 
 		 262 aa  371  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0783  YaeC family lipoprotein  69.36 
 
 		 263 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  58.91 
 
 		 259 aa  322  4e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  58.14 
 
 		 259 aa  318  7.999999999999999e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  58.65 
 
 		 266 aa  317  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  57.75 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  57.14 
 
 		 258 aa  308  5e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  57.14 
 
 		 258 aa  308  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  61 
 
 		 264 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  60.08 
 
 		 266 aa  305  6e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  60.08 
 
 		 266 aa  305  6e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  59.51 
 
 		 272 aa  304  9.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  59.39 
 
 		 281 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  60.92 
 
 		 258 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  57.89 
 
 		 266 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  58.49 
 
 		 265 aa  296  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  57.89 
 
 		 266 aa  295  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  55.6 
 
 		 258 aa  295  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  55.29 
 
 		 264 aa  294  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  57.2 
 
 		 264 aa  292  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0922  signal peptide protein  61.86 
 
 		 266 aa  291  7e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  61.34 
 
 		 265 aa  289  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  61.16 
 
 		 265 aa  289  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.81 
 
 		 270 aa  288  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2986  lipoprotein, YaeC family  61.34 
 
 		 265 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.00263956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  53.1 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  54.07 
 
 		 270 aa  285  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  57.56 
 
 		 257 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  55.35 
 
 		 271 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  55.35 
 
 		 271 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  55.35 
 
 		 271 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  52.51 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  57.98 
 
 		 257 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  54.61 
 
 		 271 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  54.61 
 
 		 271 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  55.56 
 
 		 270 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1652  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  57.89 
 
 		 266 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  59.75 
 
 		 264 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1020  YaeC family lipoprotein  59.34 
 
 		 264 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0582  lipoprotein YaeC  59.34 
 
 		 264 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1061  YaeC family lipoprotein  59.34 
 
 		 264 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  54.61 
 
 		 271 aa  279  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  57.5 
 
 		 281 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  58.61 
 
 		 264 aa  279  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0941  YaeC family lipoprotein  59.41 
 
 		 264 aa  278  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  53.51 
 
 		 271 aa  279  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  59.02 
 
 		 268 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  57.92 
 
 		 272 aa  278  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  59.02 
 
 		 268 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2134  D-methionine-binding lipoprotein metQ  54.26 
 
 		 297 aa  278  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  57.5 
 
 		 272 aa  278  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  57.5 
 
 		 272 aa  278  6e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  57.5 
 
 		 272 aa  278  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  57.5 
 
 		 272 aa  278  6e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  57.5 
 
 		 272 aa  278  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  56.73 
 
 		 272 aa  278  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  58.61 
 
 		 268 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0787  D-methionine-binding lipoprotein metQ  54.31 
 
 		 266 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2103  D-methionine-binding lipoprotein metQ  55.21 
 
 		 269 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83423  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1501  D-methionine-binding lipoprotein metQ  55.21 
 
 		 269 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  57.92 
 
 		 268 aa  277  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5310  YaeC family lipoprotein  58.33 
 
 		 268 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0468  YaeC family lipoprotein  58.16 
 
 		 259 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0371  YaeC family lipoprotein  58.16 
 
 		 259 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  52.99 
 
 		 268 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4767  YaeC family lipoprotein  58.33 
 
 		 268 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0778  lipoprotein YaeC  54.36 
 
 		 268 aa  275  7e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1802  D-methionine-binding lipoprotein metQ  57.74 
 
 		 259 aa  274  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2978  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  62.03 
 
 		 266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0226  YaeC family lipoprotein  58.33 
 
 		 268 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.951808 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2868  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  62.03 
 
 		 266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.257161  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  53.44 
 
 		 262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0217  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  57.95 
 
 		 264 aa  272  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0412  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  58.3 
 
 		 259 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2556  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  57.95 
 
 		 264 aa  272  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0932  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  58.3 
 
 		 259 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2603  lipoprotein, YaeC family  52.57 
 
 		 260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.946899  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2929  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  61.86 
 
 		 266 aa  271  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  55.65 
 
 		 529 aa  267  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  51.88 
 
 		 271 aa  267  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  52.61 
 
 		 270 aa  265  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1905  lipoprotein, YaeC family  53.11 
 
 		 286 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279671  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  53.97 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  53.56 
 
 		 268 aa  262  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  50 
 
 		 274 aa  258  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3174  YaeC family lipoprotein  50.84 
 
 		 269 aa  255  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0987485  hitchhiker  0.00336429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2369  NLPA lipoprotein  60.39 
 
 		 246 aa  249  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0617625  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  49.39 
 
 		 260 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  51.03 
 
 		 263 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3792  YaeC family lipoprotein  48.24 
 
 		 265 aa  244  6.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293535  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1614  NLPA lipoprotein  49.58 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.141443  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3405  lipoprotein, YaeC family  51.45 
 
 		 271 aa  239  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434725  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  51.45 
 
 		 271 aa  239  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0209  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  51.45 
 
 		 271 aa  239  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.127497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  48.52 
 
 		 278 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0191  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  51.45 
 
 		 271 aa  238  9e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0075131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  51.45 
 
 		 271 aa  238  9e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000208912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>