More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2852 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4650  Gamma-glutamyltransferase  55.82 
 
 		 594 aa  678    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5360  gamma-glutamyltransferase  60.27 
 
 		 594 aa  728    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2965  gamma-glutamyltransferase  74.67 
 
 		 599 aa  936    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4674  gamma-glutamyltransferase  56.25 
 
 		 592 aa  637    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4106  Gamma-glutamyltransferase  57.07 
 
 		 594 aa  696    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4046  gamma-glutamyltranspeptidase  54.52 
 
 		 624 aa  658    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358962  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0049  Gamma-glutamyltransferase  60.07 
 
 		 593 aa  645    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3779  Gamma-glutamyltransferase  57.72 
 
 		 593 aa  697    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2852  putative gamma-glutamyltranspeptidase  100 
 
 		 600 aa  1227    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00700  gamma-glutamyltransferase 2  56.15 
 
 		 594 aa  635    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1089  Gamma-glutamyltransferase  56.19 
 
 		 607 aa  629  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19053  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3965  gamma-glutamyltransferase  53.62 
 
 		 609 aa  621  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322229  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6122  Gamma-glutamyltransferase  57.83 
 
 		 597 aa  614  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223308  normal  0.010406 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3531  gamma-glutamyltransferase  53.34 
 
 		 613 aa  614  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0574  gamma-glutamyltranspeptidase  53.8 
 
 		 601 aa  606  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0896  gamma-glutamyltransferase  53.82 
 
 		 615 aa  601  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0464  Gamma-glutamyltransferase  54.74 
 
 		 616 aa  584  1.0000000000000001e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0782147  normal  0.0485525 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0148  Gamma-glutamyltransferase  53.71 
 
 		 601 aa  541  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0170697  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3004  Gamma-glutamyltransferase  52.69 
 
 		 612 aa  537  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5278  Gamma-glutamyltransferase  32.4 
 
 		 642 aa  281  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2757  Gamma-glutamyltransferase  34.93 
 
 		 586 aa  271  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147984 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  32.5 
 
 		 564 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3042  gamma-glutamyltransferase  34.02 
 
 		 630 aa  261  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  32.39 
 
 		 570 aa  259  7e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  32.39 
 
 		 570 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  32.39 
 
 		 570 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  32.09 
 
 		 570 aa  257  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1305  Gamma-glutamyltransferase  30.27 
 
 		 643 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82304 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  32.23 
 
 		 570 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  31.45 
 
 		 545 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3078  gamma-glutamyltransferase 2  34.48 
 
 		 562 aa  253  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.588204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  31.45 
 
 		 570 aa  250  5e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  31.45 
 
 		 570 aa  250  5e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  31.45 
 
 		 570 aa  250  6e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  32.5 
 
 		 590 aa  247  4.9999999999999997e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  31.97 
 
 		 573 aa  246  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  31.65 
 
 		 565 aa  245  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  31.33 
 
 		 568 aa  243  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  30.91 
 
 		 563 aa  243  6e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  31.65 
 
 		 593 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  32.49 
 
 		 553 aa  239  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  33.21 
 
 		 543 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  31.22 
 
 		 579 aa  231  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  30.32 
 
 		 563 aa  230  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  30.38 
 
 		 541 aa  228  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  29.81 
 
 		 601 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  30.94 
 
 		 565 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  29.3 
 
 		 561 aa  219  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  33.15 
 
 		 542 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4601  gamma-glutamyltransferase  28.27 
 
 		 583 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00594681  normal  0.046207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  28.09 
 
 		 583 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  28.99 
 
 		 534 aa  200  6e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  29.17 
 
 		 581 aa  200  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  31.45 
 
 		 527 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  28.6 
 
 		 587 aa  198  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  31.6 
 
 		 536 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  29.56 
 
 		 580 aa  197  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  31.39 
 
 		 533 aa  195  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3128  gamma-glutamyltransferase  28.41 
 
 		 587 aa  195  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  28.02 
 
 		 586 aa  195  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  33.6 
 
 		 542 aa  194  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  30.02 
 
 		 512 aa  194  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  28.09 
 
 		 530 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3760  gamma-glutamyltransferase  32.08 
 
 		 620 aa  194  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  29.74 
 
 		 529 aa  194  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  30.57 
 
 		 534 aa  194  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  27.21 
 
 		 604 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  28.7 
 
 		 590 aa  193  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  30.81 
 
 		 533 aa  193  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1625  gamma-glutamyltransferase  29.06 
 
 		 578 aa  193  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441001  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  31.62 
 
 		 531 aa  190  5.999999999999999e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3565  gamma-glutamyltransferase 1  29.25 
 
 		 575 aa  190  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  28.17 
 
 		 599 aa  190  8e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  29.62 
 
 		 531 aa  189  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  27.29 
 
 		 581 aa  189  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0996  gamma-glutamyltransferase 1  27.66 
 
 		 583 aa  189  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  27.74 
 
 		 556 aa  188  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0026  gamma-glutamyltransferase  28.88 
 
 		 599 aa  187  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.165843  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  28.32 
 
 		 583 aa  188  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  31.79 
 
 		 538 aa  187  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  29.9 
 
 		 533 aa  188  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  29.37 
 
 		 534 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1057  gamma-glutamyltransferase  27.91 
 
 		 587 aa  187  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  28.13 
 
 		 556 aa  187  7e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3041  gamma-glutamyltransferase  30.36 
 
 		 574 aa  186  8e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  31.08 
 
 		 558 aa  186  9e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04350  lincomycin-condensing protein lmbA, putative  26.65 
 
 		 592 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00329151  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  27.46 
 
 		 587 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3613  gamma-glutamyltransferase  27.3 
 
 		 583 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4754  gamma-glutamyltransferase  27.3 
 
 		 583 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.436981 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  27.96 
 
 		 597 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0691  gamma-glutamyltranspeptidase  28.65 
 
 		 575 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  29.96 
 
 		 536 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0062  gamma-glutamyltransferase  27.79 
 
 		 592 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  26.79 
 
 		 576 aa  185  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5529  gamma-glutamyltransferase  27.3 
 
 		 583 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383086  normal  0.95621 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  27.61 
 
 		 576 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  31.17 
 
 		 540 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  29.13 
 
 		 578 aa  184  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0787  gamma-glutamyltranspeptidase  28.27 
 
 		 575 aa  184  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>