More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1568 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1568  putative cation transport ATPase  100 
 
 
703 aa  1427    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  0.0140586 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0220  heavy metal translocating P-type ATPase  40.46 
 
 
743 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5064  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  41.01 
 
 
770 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00217431  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0992  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  39.56 
 
 
737 aa  463  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519582  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2999  heavy metal translocating P-type ATPase  38.14 
 
 
805 aa  465  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000764735  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3361  heavy metal translocating P-type ATPase  36.1 
 
 
755 aa  449  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3584  heavy metal translocating P-type ATPase  37.23 
 
 
723 aa  445  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.278523 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1344  heavy metal translocating P-type ATPase  34.78 
 
 
702 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2997  heavy metal translocating P-type ATPase  34.83 
 
 
819 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988756  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2844  heavy metal translocating P-type ATPase  32.94 
 
 
872 aa  379  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122153 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0546  heavy metal translocating P-type ATPase  34.92 
 
 
766 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0714  heavy metal translocating P-type ATPase  31.39 
 
 
698 aa  371  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.673424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1346  heavy metal translocating P-type ATPase  37.06 
 
 
693 aa  372  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000243263 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2820  heavy metal translocating P-type ATPase  32.15 
 
 
872 aa  365  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2001  heavy metal translocating P-type ATPase  33.24 
 
 
829 aa  358  9.999999999999999e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.790447  normal  0.138188 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13299  metal cation transporter P-type ATPase C ctpC  33.15 
 
 
718 aa  348  3e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.685827  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6437  heavy metal translocating P-type ATPase  33.98 
 
 
817 aa  345  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3854  heavy metal translocating P-type ATPase  33.98 
 
 
747 aa  345  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000610178  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0473  heavy metal translocating P-type ATPase  32.47 
 
 
699 aa  341  2.9999999999999998e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0060  heavy metal translocating P-type ATPase  38.09 
 
 
752 aa  340  7e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1417  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 
971 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2796  heavy metal translocatin P-type ATPase  32.85 
 
 
718 aa  330  6e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0495  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
716 aa  327  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2905  heavy metal translocating P-type ATPase  33.67 
 
 
712 aa  325  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.850846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0290  heavy metal translocating P-type ATPase  32.76 
 
 
734 aa  324  4e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106474  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1911  heavy metal translocating P-type ATPase  32.53 
 
 
839 aa  323  6e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1389  tetrapyrrole methylase family protein  30.54 
 
 
691 aa  323  8e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.512552  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  35.24 
 
 
818 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1377  heavy metal translocating P-type ATPase subfamily protein  29.49 
 
 
691 aa  318  2e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3193  heavy metal translocating P-type ATPase  31.64 
 
 
701 aa  317  4e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0353  metal transporting atpase Mta72  30.93 
 
 
696 aa  317  6e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.699181  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22710  heavy metal translocating P-type ATPase protein  33.69 
 
 
719 aa  315  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1752  heavy metal translocating P-type ATPase  34.25 
 
 
718 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00181407  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0831  metal transporting atpase Mta72  30.29 
 
 
691 aa  313  9e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0130757  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  29.94 
 
 
797 aa  312  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  33.46 
 
 
889 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  33.46 
 
 
889 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  35.07 
 
 
817 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3620  heavy metal translocating P-type ATPase  33.53 
 
 
731 aa  304  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0453  heavy metal translocating P-type ATPase  33.94 
 
 
630 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.153075 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1763  heavy metal translocating P-type ATPase  33.05 
 
 
720 aa  303  5.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20140  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  35.07 
 
 
628 aa  303  7.000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0159818  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  36.47 
 
 
839 aa  303  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2577  heavy metal translocating P-type ATPase  33.29 
 
 
698 aa  301  4e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0984175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  33.98 
 
 
806 aa  300  4e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
894 aa  300  5e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  35.02 
 
 
753 aa  300  5e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  34.67 
 
 
734 aa  300  7e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4952  heavy metal translocating P-type ATPase  34.55 
 
 
648 aa  299  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.33362  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  30.71 
 
 
767 aa  298  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  28.81 
 
 
798 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2339  heavy metal translocating P-type ATPase  33.5 
 
 
643 aa  299  2e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  34.53 
 
 
792 aa  298  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  33.79 
 
 
805 aa  297  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  34.17 
 
 
804 aa  298  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.930349 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  29.87 
 
 
783 aa  298  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  33.79 
 
 
806 aa  297  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  28.78 
 
 
833 aa  297  5e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1083  heavy metal translocating P-type ATPase  29.93 
 
 
698 aa  297  6e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0265246  hitchhiker  0.000000000000296825 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  34.55 
 
 
805 aa  297  6e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  33.79 
 
 
805 aa  297  6e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  29.86 
 
 
797 aa  296  6e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  33.79 
 
 
805 aa  296  6e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  34.55 
 
 
805 aa  297  6e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  32.74 
 
 
758 aa  296  8e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1098  heavy metal translocating P-type ATPase  34.59 
 
 
693 aa  296  8e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000158544  hitchhiker  0.0000000000000761512 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  33.59 
 
 
805 aa  296  9e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  32.82 
 
 
743 aa  296  9e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4847  copper-translocating P-type ATPase  35.63 
 
 
818 aa  296  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.24461 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  32.8 
 
 
976 aa  296  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  33.79 
 
 
805 aa  295  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1944  heavy metal translocating P-type ATPase  29.75 
 
 
695 aa  294  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136781  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  33.82 
 
 
827 aa  294  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  32.43 
 
 
817 aa  294  5e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  32.43 
 
 
817 aa  294  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  34.07 
 
 
840 aa  293  7e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1876  cation transport ATPase  33.65 
 
 
644 aa  293  9e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000004202 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  33.59 
 
 
806 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  29.8 
 
 
750 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  35.9 
 
 
804 aa  292  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  32.63 
 
 
712 aa  292  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  32.1 
 
 
712 aa  291  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  32.81 
 
 
857 aa  291  4e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  34.24 
 
 
833 aa  290  4e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  29.38 
 
 
712 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0431  copper-translocating P-type ATPase  33.27 
 
 
645 aa  290  6e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000145431  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0034  heavy metal translocating P-type ATPase  27.32 
 
 
691 aa  290  7e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.205705  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1313  heavy metal translocating P-type ATPase  32.82 
 
 
868 aa  289  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000605467  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  34.44 
 
 
811 aa  289  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  34.44 
 
 
811 aa  289  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09580  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  34.64 
 
 
639 aa  288  2e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.477007  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  31.9 
 
 
814 aa  288  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  35.05 
 
 
759 aa  288  2e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1461  heavy metal translocating P-type ATPase  32.61 
 
 
768 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1481  heavy metal translocating P-type ATPase  32.61 
 
 
768 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0180195  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  34.25 
 
 
786 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1935  copper-translocating P-type ATPase  33.46 
 
 
822 aa  287  4e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3666  copper-translocating P-type ATPase  33.94 
 
 
845 aa  287  4e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  34.07 
 
 
836 aa  286  7e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  32.04 
 
 
838 aa  286  8e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>