More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5791 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  100 
 
 
236 aa  486  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0406  glutathione S-transferase domain-containing protein  71.55 
 
 
235 aa  353  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157624  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0468  Glutathione S-transferase domain  68.51 
 
 
236 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489326  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0513  Glutathione S-transferase domain protein  68.09 
 
 
236 aa  345  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2123  putative glutathione S-transferase  62.98 
 
 
234 aa  305  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0345909  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1961  putative glutathione S-transferase  62.98 
 
 
234 aa  305  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1980  putative glutathione S-transferase  62.98 
 
 
234 aa  305  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110675  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0909  putative glutathione S-transferase  62.98 
 
 
234 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0259435  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1591  putative glutathione S-transferase  62.98 
 
 
234 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.161795  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0251  putative glutathione S-transferase  62.98 
 
 
234 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288754  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2390  glutathione S-transferase, putative  61.7 
 
 
362 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223257  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1151  glutathione S-transferase, putative  62.13 
 
 
234 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3350  putative glutathione S-transferase  60 
 
 
235 aa  298  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0097  glutathione S-transferase-like  61.11 
 
 
234 aa  297  8e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.472902  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1203  glutathione S-transferase-like  60.68 
 
 
234 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1682  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.68 
 
 
234 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3732  Glutathione S-transferase domain protein  60.26 
 
 
234 aa  296  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1147  Glutathione S-transferase domain  59.57 
 
 
235 aa  294  8e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4836  glutathione S-transferase-like protein  60.26 
 
 
234 aa  294  9e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.33242  hitchhiker  0.00725172 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1580  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.43 
 
 
234 aa  293  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.758866  normal  0.296422 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1563  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.26 
 
 
234 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.221401 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1655  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.26 
 
 
234 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440036  normal  0.557594 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1581  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.97 
 
 
234 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0242583  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1600  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.97 
 
 
234 aa  291  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  0.388565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1529  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.55 
 
 
235 aa  291  9e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623828  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3752  glutathione S-transferase-like protein  59.91 
 
 
235 aa  290  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129793  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1547  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.83 
 
 
234 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1375  glutathione S-transferase-like  59.4 
 
 
234 aa  288  7e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0090  glutathione S-transferase  60.43 
 
 
234 aa  286  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162685  normal  0.0936415 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3984  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.34 
 
 
255 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.31338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3750  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.43 
 
 
234 aa  286  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1531  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.68 
 
 
233 aa  284  8e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.195621  normal  0.284704 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4929  glutathione S-transferase  56.6 
 
 
235 aa  283  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.574827  normal  0.56518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4017  glutathione S-transferase-like  58.55 
 
 
234 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.97 
 
 
240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3976  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.83 
 
 
232 aa  278  4e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0240  glutathione S-transferase domain protein  60.85 
 
 
232 aa  276  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3493  glutathione S-transferase  57.26 
 
 
244 aa  276  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0558771  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0234  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.38 
 
 
234 aa  275  6e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4104  glutathione S-transferase family protein  57.76 
 
 
231 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606268  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0798  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.65 
 
 
237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.808485  normal  0.965794 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1760  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.76 
 
 
231 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0130582 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0097  glutathione S-transferase-like protein  57.87 
 
 
234 aa  270  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.303692  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3378  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.19 
 
 
231 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3677  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.76 
 
 
231 aa  269  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145175  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0127  glutathione S-transferase family protein  55.74 
 
 
234 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2264  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.59 
 
 
238 aa  262  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0456  glutathione S-transferase-like  54.43 
 
 
233 aa  251  9.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.02 
 
 
231 aa  246  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0551186 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5174  glutathione S-transferase-like  53.12 
 
 
232 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8437  Glutathione S-transferase domain protein  53.57 
 
 
231 aa  245  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0512  glutathione S-transferase-like protein  52.68 
 
 
229 aa  245  4e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.624431  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3326  Glutathione S-transferase domain protein  57.51 
 
 
205 aa  229  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  51.87 
 
 
222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  50 
 
 
230 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  49.53 
 
 
230 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.4 
 
 
222 aa  210  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43530  hypothetical protein  53.49 
 
 
220 aa  209  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2866  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.93 
 
 
222 aa  209  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0201506 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  51.4 
 
 
222 aa  209  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  50.24 
 
 
234 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.93 
 
 
222 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3650  hypothetical protein  53.49 
 
 
220 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328113  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1416  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.93 
 
 
222 aa  208  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1393  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.93 
 
 
222 aa  208  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2966  Glutathione S-transferase domain protein  50.93 
 
 
222 aa  208  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183097  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.94 
 
 
231 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1377  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.93 
 
 
222 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.682685  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0528  putative glutathione S-transferase  49.07 
 
 
222 aa  207  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0131  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.07 
 
 
208 aa  207  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1486  glutathione S-transferase  51.42 
 
 
204 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  48.11 
 
 
230 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1306  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.47 
 
 
222 aa  206  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  49.53 
 
 
230 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  49.53 
 
 
230 aa  204  8e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.53 
 
 
230 aa  204  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  49.53 
 
 
255 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.53 
 
 
230 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.06 
 
 
230 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3435  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 
222 aa  203  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.288694  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.53 
 
 
230 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  47.17 
 
 
230 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.11 
 
 
230 aa  201  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.89 
 
 
230 aa  201  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  51.17 
 
 
235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1349  Glutathione S-transferase domain protein  50.47 
 
 
236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  46.51 
 
 
233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2962  glutathione S-transferase-like  46.76 
 
 
234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00663  Glutathione S-transferase  47.44 
 
 
219 aa  198  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3292  putative glutathione S-transferase  48.13 
 
 
222 aa  198  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000024408 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3320  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.77 
 
 
209 aa  198  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000262213  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0906  hypothetical protein  51.64 
 
 
228 aa  197  9e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.719726  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0891  glutathione S-transferase-like protein  49.04 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2563  Glutathione S-transferase domain protein  48.36 
 
 
209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185641  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1459  glutathione S-transferase-like protein  48.58 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0619383 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2784  Glutathione S-transferase domain protein  47.89 
 
 
208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000939416  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  45.28 
 
 
230 aa  195  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3983  glutathione S-transferase-like  47.44 
 
 
219 aa  195  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.409574  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.36 
 
 
242 aa  194  9e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.58 
 
 
233 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.601516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>