117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5619 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5619  polyketide synthase  100 
 
 		 93 aa  190  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00123968  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1973  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.57 
 
 		 544 aa  77  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1647  phosphopantetheine-binding  43.02 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.546913 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  43.06 
 
 		 2103 aa  72.4  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5324  beta-ketoacyl synthase  43.66 
 
 		 897 aa  72  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0027  phosphopantetheine-binding  43.42 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0175854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0029  phosphopantetheine-binding  43.42 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4741  phosphopantetheine-binding  40 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711261  normal  0.224545 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  41.18 
 
 		 2762 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  43.28 
 
 		 1656 aa  67  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4453  phosphopantetheine-binding protein  38.16 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  37.84 
 
 		 2162 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  35.96 
 
 		 506 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  39.08 
 
 		 662 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1157  putative polyketide synthase subunit  37.33 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0280  polyketide synthase, putative  37.33 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2939  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  37.33 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2785  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  37.33 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2735  phosphopantetheine-binding  38.89 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3102  phosphopantetheine-binding  38.2 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0141016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3020  phosphopantetheine-binding  38.2 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01916  hypothetical protein  38.24 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.41353  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8815  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  35.71 
 
 		 2111 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39915  normal  0.217366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  39.71 
 
 		 2333 aa  57.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2455  histidine kinase  36.71 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  36.36 
 
 		 1474 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  30.86 
 
 		 505 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  40.3 
 
 		 1939 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1204  putative polyketide synthase  36.76 
 
 		 4212 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0168  putative polyketide synthase  36.76 
 
 		 5822 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0446  putative polyketide synthase  36.76 
 
 		 5778 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1479  putative polyketide synthase PksL  36.76 
 
 		 5915 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1394  putative polyketide synthase PksL  36.76 
 
 		 5993 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  35.62 
 
 		 1876 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3405  phosphopantetheine-binding  30.77 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2877  phosphopantetheine-binding  34.15 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.280459 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5327  phosphopantetheine-binding  35.71 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  30.95 
 
 		 3337 aa  53.5  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1606  phosphopantetheine-binding  36.99 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.607416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  29.49 
 
 		 1823 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  34.25 
 
 		 1828 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0215  Beta-ketoacyl synthase  33.77 
 
 		 1759 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  31.76 
 
 		 1580 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0180  hypothetical protein  36.23 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  32.39 
 
 		 1580 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  32.39 
 
 		 1580 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1669  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  36.23 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1587  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  36.23 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.059476  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18390  phosphopantetheine-containing protein  31.33 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.674444  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  34.33 
 
 		 6889 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1019  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  35.21 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00932782  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0274  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  35.21 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3852  beta-ketoacyl synthase  37.29 
 
 		 1744 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534518 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0296  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  35.21 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.444896  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1797  Acyl carrier protein  35.21 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1711  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  35.21 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1299  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  35.21 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2887  Beta-ketoacyl synthase  35.62 
 
 		 1208 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6560  acyl carrier protein  33.82 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273089 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 701 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4853  Acyl transferase  27.06 
 
 		 1819 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1219  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  34.78 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5010  mycolic acid condensase  30.86 
 
 		 1850 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5098  mycolic acid condensase  30.86 
 
 		 1850 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5391  mycolic acid condensase  30.86 
 
 		 1841 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.568304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2690  beta-ketoacyl synthase  31.34 
 
 		 1698 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.588409  normal  0.25936 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  40.91 
 
 		 3099 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1480  putative polyketide synthase PksJ  35.29 
 
 		 5023 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0001  polyketide synthase  35.29 
 
 		 4874 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1395  putative polyketide synthase PksJ  35.29 
 
 		 5021 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5296  Beta-ketoacyl synthase  32.89 
 
 		 5802 aa  47  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0721794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  26.92 
 
 		 1581 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0167  putative polyketide synthase PksJ  35.29 
 
 		 3818 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3958  AMP-dependent synthetase and ligase  29.73 
 
 		 707 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0860  Beta-ketoacyl synthase  33.85 
 
 		 4036 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3095  beta-ketoacyl synthase  27.38 
 
 		 7157 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2597  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  33.8 
 
 		 2284 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  38.98 
 
 		 4840 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2600  Beta-ketoacyl synthase  39.13 
 
 		 2543 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5291  erythronolide synthase, Mycocerosate synthase  37.29 
 
 		 4588 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  26.76 
 
 		 1577 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1024  beta-ketoacyl synthase  32 
 
 		 2053 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11681  polyketide synthase pks17  37.74 
 
 		 502 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000530022  normal  0.704924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  26.98 
 
 		 1835 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1430  KR domain protein  27.85 
 
 		 5612 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3472  beta-ketoacyl synthase  30 
 
 		 1704 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3535  beta-ketoacyl synthase  30 
 
 		 1704 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2782  Beta-ketoacyl synthase  41.3 
 
 		 899 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0331764  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  30.14 
 
 		 4183 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3485  beta-ketoacyl synthase  30 
 
 		 1704 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1425  KR domain protein  31.51 
 
 		 6876 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0175  Beta-ketoacyl synthase  25.58 
 
 		 1704 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2456  hypothetical protein  29.17 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  37.29 
 
 		 991 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1185  Acyl transferase  28.05 
 
 		 626 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29828  predicted protein  33.33 
 
 		 4962 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1906  phosphopantetheine-binding  31.17 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  36.21 
 
 		 2547 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2974  6-deoxyerythronolide-B synthase., (Acyl-carrier- protein) S-malonyltransferase  30.99 
 
 		 2719 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  35.59 
 
 		 1190 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>