22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2455 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2455  histidine kinase  100 
 
 		 85 aa  171  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2456  hypothetical protein  36.23 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5619  polyketide synthase  36.71 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00123968  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  31.94 
 
 		 1474 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4741  phosphopantetheine-binding  28.57 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711261  normal  0.224545 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5327  phosphopantetheine-binding  26.76 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4619 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  27.59 
 
 		 2103 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  29.11 
 
 		 2762 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3102  phosphopantetheine-binding  24.36 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0141016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3020  phosphopantetheine-binding  24.36 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  25.33 
 
 		 2162 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1647  phosphopantetheine-binding  30.91 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.546913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13834  polyketide synthase pks13  27.63 
 
 		 1733 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.924162 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0280  polyketide synthase, putative  25 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18390  phosphopantetheine-containing protein  28.77 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.674444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0029  phosphopantetheine-binding  28.07 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0027  phosphopantetheine-binding  28.07 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0175854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2785  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  23.68 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2939  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  23.68 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  32 
 
 		 3337 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1157  putative polyketide synthase subunit  23.68 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  26.23 
 
 		 506 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>