208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0550 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  100 
 
 		 233 aa  487  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  57.08 
 
 		 240 aa  274  8e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  45.54 
 
 		 236 aa  204  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  41.88 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  41.53 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  39.33 
 
 		 243 aa  180  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  40.17 
 
 		 243 aa  180  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  39.26 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  39.75 
 
 		 243 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  39.33 
 
 		 243 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  39.15 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  38.49 
 
 		 243 aa  175  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  39.17 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  36.6 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  39.57 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  39.57 
 
 		 244 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  40 
 
 		 228 aa  171  6.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  38.08 
 
 		 243 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  39.57 
 
 		 244 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  39.83 
 
 		 243 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0846  DSBA oxidoreductase  39.83 
 
 		 243 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96876  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  40.47 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0818  DSBA oxidoreductase  39.83 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  38.79 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3936  DSBA oxidoreductase  39.39 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.763999  hitchhiker  0.00370443 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  35.66 
 
 		 244 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  38.08 
 
 		 239 aa  166  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2541  DSBA oxidoreductase  38.96 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  37.85 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  40.1 
 
 		 220 aa  162  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  34.91 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1893  DSBA oxidoreductase  36.4 
 
 		 238 aa  158  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  40.29 
 
 		 208 aa  158  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  40.38 
 
 		 209 aa  156  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  39.05 
 
 		 215 aa  153  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  40 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  37.38 
 
 		 209 aa  152  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  35.06 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  38.54 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  40.47 
 
 		 218 aa  149  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  37.38 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  39.02 
 
 		 212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2343  DSBA oxidoreductase  34.2 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590857  normal  0.036783 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  35.44 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2368  DSBA oxidoreductase  39.61 
 
 		 203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.919583  normal  0.0250813 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4148  DSBA oxidoreductase  36.97 
 
 		 241 aa  145  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  37.75 
 
 		 213 aa  145  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  37.33 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  39.8 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  35.41 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0591  DSBA oxidoreductase  34.03 
 
 		 238 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.699138  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  38.35 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1160  dithiol-disulfide isomerase  34.13 
 
 		 223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000467454  hitchhiker  3.85744e-21 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  35.07 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  33.48 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  36.1 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  34.8 
 
 		 216 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  34.62 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  33.66 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0979  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 215 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00033798  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  34.27 
 
 		 248 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  33.81 
 
 		 225 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4261  isomerase, putative  30.57 
 
 		 232 aa  118  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  33.76 
 
 		 231 aa  118  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  35.58 
 
 		 221 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  31.71 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  33.98 
 
 		 217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  33.82 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1278  DSBA oxidoreductase  31.78 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000336164  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  37.19 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  33.19 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5788  DSBA oxidoreductase  33.8 
 
 		 215 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487063 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 		 220 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  33.33 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  31.63 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1639  DSBA oxidoreductase  36.61 
 
 		 250 aa  112  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  30.99 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  34.69 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  31.16 
 
 		 220 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2296  DSBA oxidoreductase  35.51 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00720993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  34.69 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  33.18 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  33.65 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  30.66 
 
 		 224 aa  108  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  30.66 
 
 		 224 aa  108  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  32.56 
 
 		 212 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4948  DSBA oxidoreductase  33.96 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.576797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  31.05 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  33.66 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  29.38 
 
 		 221 aa  105  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 221 aa  105  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  30.92 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  29.72 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  31.73 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  31.73 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0796  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 		 221 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.861655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>