More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1528 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
129 aa  239  7.999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  75.97 
 
 
129 aa  148  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  76.42 
 
 
125 aa  143  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0311  ribosomal protein L7/L12  72.09 
 
 
127 aa  141  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181788  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  68 
 
 
126 aa  140  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  64.52 
 
 
125 aa  140  7e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  69.77 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  76.19 
 
 
128 aa  136  8.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  71.54 
 
 
122 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  59.69 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  71.54 
 
 
122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  68.6 
 
 
123 aa  131  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  65.12 
 
 
127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  69.11 
 
 
125 aa  130  6.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  68 
 
 
126 aa  130  7.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  63.85 
 
 
129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  72 
 
 
126 aa  127  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  69.6 
 
 
124 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1144  ribosomal protein L7/L12  64.84 
 
 
127 aa  124  5e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000177036  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  69.6 
 
 
124 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  67.48 
 
 
119 aa  122  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
125 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  68.03 
 
 
125 aa  122  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
123 aa  123  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 
125 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 
121 aa  121  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  54.96 
 
 
129 aa  121  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  59.69 
 
 
126 aa  121  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 
124 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  64.52 
 
 
123 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  63.41 
 
 
125 aa  120  6e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  67.21 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  63.71 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  60.33 
 
 
124 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  65.04 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0362  50S ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 
120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00344046  hitchhiker  0.0000691271 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  65.57 
 
 
124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 
123 aa  118  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  62.9 
 
 
123 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  64.8 
 
 
125 aa  118  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  66.13 
 
 
125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2696  50S ribosomal protein L7/L12  68.85 
 
 
123 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10114  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  66.13 
 
 
124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  64.52 
 
 
125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  65.57 
 
 
126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3247  50S ribosomal protein L7/L12  60.47 
 
 
126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0356  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 
124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0227516  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  63.41 
 
 
124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  64.75 
 
 
124 aa  117  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  64.75 
 
 
124 aa  117  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  64.52 
 
 
124 aa  117  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
124 aa  117  7e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0095  50S ribosomal protein L7/L12  65.85 
 
 
119 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000523808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3817  50S ribosomal protein L7/L12  65.81 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1913  50S ribosomal protein L7/L12  65.81 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000803393  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2642  50S ribosomal protein L7/L12  65.81 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3787  50S ribosomal protein L7/L12  65.81 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229849  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3755  50S ribosomal protein L7/L12  65.81 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.062938  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  63.64 
 
 
126 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  63.41 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3468  50S ribosomal protein L7/L12  65.81 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108927  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3898  50S ribosomal protein L7/L12  59.69 
 
 
126 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3179  50S ribosomal protein L7/L12  65.81 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000124958  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  66.1 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  63.41 
 
 
121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  63.41 
 
 
121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  62.1 
 
 
123 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  65.57 
 
 
126 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4532  50S ribosomal protein L7/L12  58.14 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  66.94 
 
 
127 aa  114  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  62.9 
 
 
126 aa  114  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0881  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 
123 aa  114  5e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.619082  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  50.82 
 
 
122 aa  114  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  50.82 
 
 
122 aa  114  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  65.85 
 
 
123 aa  114  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_862  ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 
124 aa  113  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000472874  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  61.79 
 
 
122 aa  113  7.999999999999999e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  63.85 
 
 
126 aa  113  7.999999999999999e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0509  50S ribosomal protein L7/L12  59.69 
 
 
125 aa  113  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17495  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0990  50S ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 
124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00236758  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  56.91 
 
 
126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  53.6 
 
 
124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1737  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1761  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  63.11 
 
 
126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0570  50S ribosomal protein L7/L12  66.39 
 
 
123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000202265  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3868  50S ribosomal protein L7/L12  55.81 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  58.68 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  68.38 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  57.72 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  59.35 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  58.68 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4317  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  63.11 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1820  ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 
133 aa  111  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  58.54 
 
 
122 aa  111  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  64.75 
 
 
123 aa  111  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2959  50S ribosomal protein L7/L12  64.52 
 
 
125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585888  normal  0.16288 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1397  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>