28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3679 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  53.03 
 
 		 833 aa  660    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  56.93 
 
 		 914 aa  688    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3679  FG-GAP repeat-containing protein  100 
 
 		 677 aa  1384    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000668501  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  56.88 
 
 		 820 aa  647    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0739  cellulosome protein dockerin type I  54.32 
 
 		 676 aa  666    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000588173  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1678  FG-GAP repeat-containing protein  53.21 
 
 		 618 aa  645    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000385209  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  52.07 
 
 		 773 aa  670    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  55.24 
 
 		 743 aa  666    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  58.01 
 
 		 1065 aa  721    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  65.27 
 
 		 1880 aa  831    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3413  FG-GAP repeat protein  83.07 
 
 		 672 aa  1115    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0215  hypothetical protein  58.51 
 
 		 787 aa  724    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.247973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  50.81 
 
 		 1266 aa  622  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3891  FG-GAP repeat protein  50.16 
 
 		 662 aa  610  1e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0201045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  51.99 
 
 		 744 aa  605  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3890  FG-GAP repeat protein  49.04 
 
 		 613 aa  585  1e-166  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.100975  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  50.5 
 
 		 746 aa  582  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  49.08 
 
 		 774 aa  527  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1343  YesW  44.55 
 
 		 658 aa  520  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4222  FG-GAP repeat-containing protein  46.46 
 
 		 616 aa  508  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  52.48 
 
 		 669 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  37.83 
 
 		 848 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0488  FG-GAP repeat protein  38.13 
 
 		 851 aa  313  5.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25650  FG-GAP repeat protein  44.47 
 
 		 1082 aa  303  8.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112985  normal  0.313827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3493  FG-GAP repeat protein  34.37 
 
 		 767 aa  301  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.832541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0343  FG-GAP repeat-containing protein  37.96 
 
 		 803 aa  267  5e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2008  putative secreted glycosyl hydrolase  45.8 
 
 		 240 aa  218  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02543  rhamnogalacturonan lyase (Eurofung)  29.36 
 
 		 606 aa  201  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>