190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0172 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0172  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  100 
 
 
333 aa  665    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0335  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  87.65 
 
 
333 aa  555  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1457  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  76.44 
 
 
331 aa  478  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217396  normal  0.856558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3915  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  69.88 
 
 
333 aa  456  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.708801  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23900  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  73.11 
 
 
331 aa  456  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0662069  normal  0.453933 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  65.47 
 
 
333 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  65.17 
 
 
333 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  65.06 
 
 
333 aa  438  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1659  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  64.86 
 
 
333 aa  439  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.0341698 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  65.86 
 
 
331 aa  440  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2616  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  66.87 
 
 
333 aa  437  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0611237  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1154  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  72.84 
 
 
335 aa  435  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543562  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6114  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  65.17 
 
 
333 aa  418  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4782  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  56.9 
 
 
355 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.797257 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  54.4 
 
 
364 aa  411  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  61.75 
 
 
332 aa  409  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29380  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  62.76 
 
 
332 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1101  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  59.64 
 
 
332 aa  394  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.550542  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0960  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  57.4 
 
 
329 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0101892  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1104  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  57.4 
 
 
329 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2582  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  56.18 
 
 
354 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  64.26 
 
 
332 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0706  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  57.4 
 
 
327 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.598011  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2201  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  51.65 
 
 
331 aa  378  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000263646  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4272  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  54.34 
 
 
356 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01175  dihydroxyacetone kinase, N-terminal domain protein  52.53 
 
 
356 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2448  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  52.53 
 
 
356 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1941  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.25 
 
 
356 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0517776 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2426  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.53 
 
 
356 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.260612 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01185  hypothetical protein  52.53 
 
 
356 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.898254  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1359  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.25 
 
 
369 aa  375  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1304  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.25 
 
 
356 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1346  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  51.97 
 
 
356 aa  375  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1178  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  55.14 
 
 
354 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516671  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0697  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  57.1 
 
 
327 aa  371  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2009  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  54.49 
 
 
354 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6364  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  54.05 
 
 
329 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0674086  normal  0.470329 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0877  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  61.52 
 
 
333 aa  366  1e-100  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3048  Glycerone kinase  60.84 
 
 
330 aa  364  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.817448 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  56.06 
 
 
332 aa  363  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0040  dihydroxyacetone kinase family protein  56.76 
 
 
329 aa  363  3e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2347  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  61.26 
 
 
333 aa  361  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5631  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  54.65 
 
 
329 aa  361  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735758  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  56.67 
 
 
332 aa  354  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  53.15 
 
 
330 aa  353  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  59.09 
 
 
332 aa  348  6e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  58.18 
 
 
332 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0698  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  51.82 
 
 
332 aa  346  3e-94  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0536678  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001638  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase dihydroxyacetone binding subunit DhaK  50.99 
 
 
352 aa  345  5e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  51.21 
 
 
329 aa  344  1e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  53.25 
 
 
331 aa  344  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4109  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.99 
 
 
330 aa  344  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.987034  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  50.46 
 
 
332 aa  335  5.999999999999999e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4858  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  48.74 
 
 
354 aa  333  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0081  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  50.77 
 
 
331 aa  331  1e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3126  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  54.57 
 
 
331 aa  329  4e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76772  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2438  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  51.36 
 
 
330 aa  325  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288269  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1458  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  55.93 
 
 
333 aa  314  9.999999999999999e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  47.88 
 
 
583 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  47.88 
 
 
583 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  47.58 
 
 
583 aa  310  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1650  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  48.57 
 
 
329 aa  309  5e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2457  Glycerone kinase  49.24 
 
 
332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  47.58 
 
 
583 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  47.58 
 
 
583 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  47.58 
 
 
583 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  47.27 
 
 
583 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  47.58 
 
 
583 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  46.06 
 
 
582 aa  302  6.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  46.06 
 
 
583 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  47.27 
 
 
583 aa  301  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  47.27 
 
 
583 aa  299  6e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3316  Glycerone kinase  50 
 
 
333 aa  295  6e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1716  dihydroxyacetone kinase  50.16 
 
 
569 aa  291  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.631887  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0779  Glycerone kinase  48.5 
 
 
546 aa  286  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4660  Glycerone kinase  48.01 
 
 
334 aa  285  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.49108 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1639  Dak kinase  43.03 
 
 
333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0196246  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4368  Glycerone kinase  45.15 
 
 
333 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4753  Glycerone kinase  47.71 
 
 
334 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0100124  normal  0.245979 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01180  dihydroxyacetone kinase  51.66 
 
 
332 aa  280  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  50.3 
 
 
567 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1361  Glycerone kinase  46.04 
 
 
333 aa  279  5e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  47.42 
 
 
567 aa  276  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6032  dihydroxyacetone kinase  48.35 
 
 
572 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1909  Glycerone kinase  47.09 
 
 
331 aa  275  6e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.366009  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0651  Glycerone kinase  42.55 
 
 
334 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0661746  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  50.61 
 
 
567 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  42.9 
 
 
695 aa  272  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  43.2 
 
 
694 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6137  dihydroxyacetone kinase  48.33 
 
 
616 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.2 
 
 
320 aa  270  2e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1080  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  44.07 
 
 
325 aa  270  2e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4101  Glycerone kinase  45.43 
 
 
544 aa  268  7e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1401  Glycerone kinase  42.42 
 
 
331 aa  268  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0864848  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5792  dihydroxyacetone kinase  47.58 
 
 
569 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6157  dihydroxyacetone kinase  47.58 
 
 
569 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0527  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase  45.35 
 
 
333 aa  268  8e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  45.62 
 
 
700 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6637  dihydroxyacetone kinase  47.58 
 
 
566 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0673  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.15 
 
 
322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.384752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>