More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1514 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1514  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
416 aa  857    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000130469  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2578  tyrosyl-tRNA synthetase  56.3 
 
 
410 aa  477  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00252994  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0723  tyrosyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 
408 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.154159  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2338  tyrosyl-tRNA synthetase  54.09 
 
 
406 aa  463  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000770628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2081  tyrosyl-tRNA synthetase  53.43 
 
 
408 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0336004  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0633  tyrosyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 
406 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0281376  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0619  tyrosyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 
406 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171861  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0861  tyrosyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 
406 aa  365  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
433 aa  360  3e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00990459  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2845  tyrosyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 
418 aa  350  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1913  tyrosyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
414 aa  348  1e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2577  tyrosyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 
435 aa  345  7e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000613291  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2452  tyrosyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 
418 aa  345  8e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2738  tyrosyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 
418 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186886  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2160  tyrosyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
425 aa  342  8e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000761331  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1668  tyrosyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 
417 aa  342  9e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.993205  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3333  tyrosyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 
418 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0619  tyrosyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 
413 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0905684  normal  0.181469 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2260  tyrosyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
417 aa  339  5e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 
405 aa  339  5.9999999999999996e-92  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0726  tyrosyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343118  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2998  tyrosyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 
418 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.243953  normal  0.0659973 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4898  tyrosyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
420 aa  336  5e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4797  tyrosyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
419 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4796  tyrosyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
418 aa  334  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152048  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5211  tyrosyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
419 aa  335  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4777  tyrosyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
419 aa  334  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4556  tyrosyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
418 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4936  tyrosyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
419 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4391  tyrosyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
418 aa  334  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.692977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4407  tyrosyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
418 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5179  tyrosyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
419 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.731963 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4911  tyrosyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
418 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.025731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5314  tyrosyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
419 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5228  tyrosyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
419 aa  333  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1906  tyrosyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 
418 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543726  normal  0.0386015 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4776  tyrosyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
418 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4770  tyrosyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
418 aa  333  4e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.110576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0466  tyrosyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
418 aa  333  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000461262  hitchhiker  0.000000000000286759 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2725  tyrosyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
419 aa  333  4e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000458338  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0714  tyrosyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
419 aa  332  5e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4793  tyrosyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
418 aa  332  5e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00466157  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5215  tyrosyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 
420 aa  332  6e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4488  tyrosyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
418 aa  332  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2032  tyrosyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
418 aa  331  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1785  tyrosyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 
417 aa  330  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.591619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0033  tyrosyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
420 aa  330  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0005431 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0927  tyrosyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 
416 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236583  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 
431 aa  330  4e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2069  tyrosyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.309186  normal  0.0187777 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3213  tyrosyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 
423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0920  tyrosyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 
417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2046  tyrosyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
418 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1473  tyrosyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
417 aa  327  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0527607  normal  0.0231492 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4041  tyrosyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 
416 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00764933  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0923  tyrosyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
417 aa  326  5e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1792  tyrosyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 
424 aa  325  7e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.787858  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0926  tyrosyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 
417 aa  325  8.000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1155  tyrosyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 
416 aa  325  9e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2987  tyrosyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 
423 aa  325  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4474  tyrosyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
416 aa  324  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2113  tyrosyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
418 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569911  normal  0.0455725 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2332  tyrosyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 
418 aa  323  3e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3171  tyrosyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
423 aa  322  5e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108493  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2581  tyrosyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 
419 aa  322  7e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0806  tyrosyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
417 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.66983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6068  Tyrosine--tRNA ligase  39.23 
 
 
422 aa  319  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1293  tyrosyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
421 aa  318  9e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1115  tyrosyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
416 aa  318  1e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0237  tyrosyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 
420 aa  318  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657814  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0020  tyrosyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
421 aa  318  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59277  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01607  tyrosyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
424 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01597  hypothetical protein  41.79 
 
 
424 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2151  tyrosyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
417 aa  317  3e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2003  tyrosyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
424 aa  316  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00229572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1713  tyrosyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
424 aa  316  4e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.205571  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3040  tyrosyl-tRNA synthetase  40 
 
 
432 aa  316  4e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1829  tyrosyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
424 aa  316  4e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2349  tyrosyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
424 aa  316  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0752557  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1992  tyrosyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
424 aa  316  4e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.013475 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
424 aa  316  4e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000014829  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1562  tyrosyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
424 aa  316  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3267  tyrosyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 
416 aa  316  5e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.762137  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5839  tyrosyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109224  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3175  tyrosyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 
424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0885439  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1773  tyrosyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1631  tyrosyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
431 aa  313  3.9999999999999997e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1979  tyrosyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 
423 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0364525  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1564  tyrosyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
425 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2554  tyrosyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
424 aa  312  6.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.268251  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1784  tyrosyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 
420 aa  312  7.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1819  tyrosyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 
420 aa  312  7.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0263  tyrosyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 
430 aa  311  1e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0113  tyrosyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 
432 aa  311  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397659  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0431  tyrosyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 
419 aa  311  1e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0825328  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2683  tyrosyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 
425 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1725  tyrosyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
424 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00254392  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1894  tyrosyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
424 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1546  tyrosyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
424 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146335  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>