More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0502 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  51.4 
 
 
759 aa  718    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  51.53 
 
 
759 aa  720    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  57.87 
 
 
752 aa  864    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  50.07 
 
 
759 aa  701    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_002950  PG0279  malic enzyme  48.6 
 
 
759 aa  667    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  51.53 
 
 
759 aa  720    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2664  malic enzyme  51.2 
 
 
759 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2123  malic enzyme  48.99 
 
 
773 aa  661    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.223978  normal  0.897782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2767  malic enzyme  48.07 
 
 
781 aa  667    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0582903  normal  0.182467 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2289  malic enzyme  46.52 
 
 
757 aa  648    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999733  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1969  malic enzyme  47.42 
 
 
756 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2760  malic enzyme  48.78 
 
 
753 aa  657    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  46.86 
 
 
751 aa  674    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3722  malic enzyme  47.49 
 
 
766 aa  650    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0295  malic enzyme  47.35 
 
 
764 aa  650    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3533  malic enzyme  47.42 
 
 
756 aa  671    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78558  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1651  malic enzyme  52.24 
 
 
763 aa  747    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1391  malic enzyme  48.34 
 
 
759 aa  672    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.603057  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4759  malic enzyme  47.58 
 
 
770 aa  642    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1243  malic enzyme  48.59 
 
 
769 aa  665    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3472  malic enzyme  49.47 
 
 
759 aa  704    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.382642  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6546  malic enzyme  49 
 
 
763 aa  695    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00415909  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2586  malic enzyme  47.42 
 
 
756 aa  671    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4106  malic enzyme  47.84 
 
 
770 aa  650    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1112  malic enzyme  48.18 
 
 
769 aa  650    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  58.02 
 
 
752 aa  847    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1367  malic enzyme  45.34 
 
 
779 aa  645    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0750  malic enzyme  48.13 
 
 
776 aa  641    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.231265 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3943  malic enzyme  48.74 
 
 
758 aa  672    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00128716  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2441  malic enzyme  49.54 
 
 
777 aa  687    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2847  malic enzyme  47.33 
 
 
774 aa  642    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0118  malic enzyme  48.45 
 
 
763 aa  679    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  47.42 
 
 
756 aa  671    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1277  malic enzyme  48.34 
 
 
759 aa  672    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0019  malic enzyme  47.42 
 
 
773 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  47.13 
 
 
752 aa  662    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2654  malic enzyme  46.87 
 
 
751 aa  657    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.820528 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1582  malic enzyme  53.03 
 
 
783 aa  769    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1269  malic enzyme  45.71 
 
 
779 aa  656    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.525931  normal  0.614845 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  46.86 
 
 
759 aa  674    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0029  malic enzyme  49.93 
 
 
761 aa  679    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000328842 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3417  malic enzyme  47.05 
 
 
756 aa  665    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154841  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0265  malic enzyme  46.88 
 
 
764 aa  648    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.8165  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  50.73 
 
 
766 aa  742    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  58.16 
 
 
752 aa  869    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  56.42 
 
 
749 aa  823    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3524  malic enzyme  47.42 
 
 
756 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753922  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3013  malic enzyme  47.68 
 
 
781 aa  663    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2786  malic enzyme  48.34 
 
 
759 aa  671    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0144029 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3542  malic enzyme  48.67 
 
 
753 aa  688    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1214  malic enzyme  51.53 
 
 
759 aa  720    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  47.28 
 
 
756 aa  671    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3930  malic enzyme  84.99 
 
 
771 aa  1323    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  100 
 
 
773 aa  1578    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3291  malic enzyme  49.8 
 
 
754 aa  662    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442539  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4026  malic enzyme  45.92 
 
 
766 aa  635    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0175  malic enzyme  48.39 
 
 
758 aa  677    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  46.93 
 
 
754 aa  665    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3876  malic enzyme  46.28 
 
 
769 aa  658    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0093  malic enzyme  46.35 
 
 
769 aa  659    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.351367  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1424  malic enzyme  46.99 
 
 
771 aa  644    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4968  malic enzyme  47.82 
 
 
762 aa  677    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1421  malic enzyme  47.73 
 
 
767 aa  652    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1262  malic enzyme  59.04 
 
 
752 aa  858    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00802649  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  46.4 
 
 
760 aa  664    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0298  malic enzyme  47.05 
 
 
756 aa  667    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000250182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2609  malic enzyme  51.53 
 
 
759 aa  719    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3123  malic enzyme  47.42 
 
 
756 aa  671    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2869  malic enzyme  46.5 
 
 
761 aa  657    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000177126 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0220  malic enzyme  47.67 
 
 
756 aa  671    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.667581  hitchhiker  0.000000000555006 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  49.27 
 
 
754 aa  714    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0997  malic enzyme  44.94 
 
 
777 aa  636    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.158987  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0878  malic enzyme  49.08 
 
 
773 aa  679    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716606  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0498  malic enzyme  47.99 
 
 
775 aa  653    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423253  normal  0.484498 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0158  malic enzyme  48.17 
 
 
764 aa  693    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2877  malic enzyme  47.33 
 
 
751 aa  673    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.857329 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2792  malic enzyme  49.46 
 
 
754 aa  669    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.776027  normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2472  malic enzyme  47.59 
 
 
779 aa  644    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.555101  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  47.05 
 
 
756 aa  668    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  51.4 
 
 
759 aa  717    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2829  malic enzyme  51.26 
 
 
759 aa  716    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.946085  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4030  malic enzyme  48.26 
 
 
761 aa  667    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  54.21 
 
 
757 aa  802    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0465  malic enzyme  48.13 
 
 
755 aa  659    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00312155  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  47.75 
 
 
764 aa  669    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0359  malic enzyme  48.41 
 
 
769 aa  659    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  47.06 
 
 
776 aa  669    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2106  malic enzyme  48.65 
 
 
765 aa  657    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.161239 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3674  malic enzyme  46.8 
 
 
760 aa  665    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0789225  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3020  malic enzyme  48.93 
 
 
761 aa  661    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0237  malic enzyme  47.59 
 
 
756 aa  666    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0245  malic enzyme  47.45 
 
 
756 aa  665    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000009441 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2263  malic enzyme  48.86 
 
 
773 aa  654    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.828164  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0224  malic enzyme  45.76 
 
 
773 aa  639    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  47.05 
 
 
756 aa  668    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02395  malic enzyme  46.17 
 
 
769 aa  645    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.766678  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3496  malic enzyme  45.92 
 
 
766 aa  637    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2777  malic enzyme  54.81 
 
 
757 aa  776    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0405643  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3352  malic enzyme  47.36 
 
 
763 aa  650    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49326  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3849  malic enzyme  47.42 
 
 
756 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>