198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0865 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  100 
 
 
182 aa  370  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  44.2 
 
 
165 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  41.99 
 
 
164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  42.22 
 
 
164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  44.75 
 
 
165 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  41.44 
 
 
184 aa  137  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  43.82 
 
 
166 aa  132  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  44.63 
 
 
164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  40.78 
 
 
172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  42.31 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  44.13 
 
 
168 aa  129  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  41.81 
 
 
185 aa  129  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  43.5 
 
 
165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  41.76 
 
 
164 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  43.58 
 
 
166 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  44.07 
 
 
168 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  40.22 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  42.05 
 
 
165 aa  125  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  42.46 
 
 
166 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  42.46 
 
 
166 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  42.46 
 
 
163 aa  124  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  41.9 
 
 
168 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  42.94 
 
 
165 aa  123  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  41.67 
 
 
166 aa  122  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  42.95 
 
 
228 aa  121  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  42.05 
 
 
184 aa  121  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  39.33 
 
 
166 aa  120  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  40.22 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  42.7 
 
 
166 aa  119  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  40.68 
 
 
182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  40.11 
 
 
165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  42.46 
 
 
167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  41.48 
 
 
184 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  41.34 
 
 
166 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  40.68 
 
 
173 aa  117  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  36.72 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  40.68 
 
 
182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  41.9 
 
 
166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  40 
 
 
166 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  42.13 
 
 
167 aa  114  8.999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  39.66 
 
 
166 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  41.44 
 
 
166 aa  112  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  41.11 
 
 
167 aa  112  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  39.66 
 
 
166 aa  111  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  37.02 
 
 
165 aa  111  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  40.34 
 
 
169 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  36.67 
 
 
168 aa  110  9e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  40 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  38.12 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  40.68 
 
 
184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  39.78 
 
 
166 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  38.12 
 
 
166 aa  107  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  38.6 
 
 
158 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  43.43 
 
 
163 aa  107  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  39.05 
 
 
166 aa  106  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  42.35 
 
 
169 aa  105  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  39.01 
 
 
166 aa  102  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  38.46 
 
 
166 aa  101  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  38.95 
 
 
170 aa  98.6  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  38.95 
 
 
170 aa  98.6  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  36.67 
 
 
202 aa  96.3  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  35.63 
 
 
233 aa  95.5  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  35.91 
 
 
194 aa  95.1  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  34.08 
 
 
169 aa  95.1  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  36.87 
 
 
167 aa  94.7  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  35.36 
 
 
194 aa  94.7  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  37.57 
 
 
202 aa  94.4  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  42.75 
 
 
140 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3337  nigerythrin  34.66 
 
 
202 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  41.18 
 
 
140 aa  93.2  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  42.03 
 
 
140 aa  93.2  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  42.75 
 
 
139 aa  93.2  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  34.81 
 
 
194 aa  93.2  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  35.09 
 
 
178 aa  92  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  34.57 
 
 
197 aa  92  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  42.03 
 
 
140 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  42.03 
 
 
140 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  42.03 
 
 
140 aa  92  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  43.48 
 
 
140 aa  91.7  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  42.03 
 
 
140 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  42.03 
 
 
140 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  42.03 
 
 
140 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  42.03 
 
 
140 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  42.03 
 
 
140 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  42.75 
 
 
140 aa  91.3  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1565  rubrerythrin  33.7 
 
 
194 aa  91.7  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  41.3 
 
 
140 aa  91.3  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  42.75 
 
 
140 aa  91.3  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  42.75 
 
 
140 aa  90.9  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  37.87 
 
 
170 aa  90.9  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  36 
 
 
216 aa  90.9  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  42.86 
 
 
140 aa  90.5  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  33.73 
 
 
263 aa  90.5  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  36 
 
 
215 aa  90.1  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  41.3 
 
 
140 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  41.3 
 
 
140 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  41.3 
 
 
140 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1649  rubrerythrin  33.33 
 
 
238 aa  89  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.429351 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  41.38 
 
 
146 aa  89  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  37.21 
 
 
181 aa  89.4  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>