270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5837 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5837  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  342  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14540  hypothetical protein  64.33 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3333  protein of unknown function DUF150  49.36 
 
 		 205 aa  135  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.295567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2114  hypothetical protein  49.35 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3193  hypothetical protein  42.95 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0250324  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3595  protein of unknown function DUF150  45.58 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7750  protein of unknown function DUF150  48.21 
 
 		 203 aa  114  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3968  protein of unknown function DUF150  45.4 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1367  hypothetical protein  46.91 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.54901  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1324  hypothetical protein  46.91 
 
 		 219 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1418  hypothetical protein  43.9 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0775  hypothetical protein  46.15 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.360947  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2150  protein of unknown function DUF150  43.04 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2311  hypothetical protein  42.47 
 
 		 176 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0442926  normal  0.0676785 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2492  protein of unknown function DUF150  38.99 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4042  hypothetical protein  40.4 
 
 		 178 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0029117  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1413  hypothetical protein  37.75 
 
 		 205 aa  92.4  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149258  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23480  hypothetical protein  40.62 
 
 		 181 aa  89.4  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0456205 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3565  hypothetical protein  46.1 
 
 		 268 aa  89  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00347083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1179  hypothetical protein  42.7 
 
 		 308 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00453705  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1058  hypothetical protein  45.81 
 
 		 171 aa  85.5  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0222222  normal  0.0438439 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1424  protein of unknown function DUF150  34.91 
 
 		 222 aa  85.5  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2079  hypothetical protein  39.24 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2125  hypothetical protein  39.24 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0426445  normal  0.0108816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2062  hypothetical protein  39.24 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1518  hypothetical protein  40.48 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190218  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1712  protein of unknown function DUF150  34.76 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  32.19 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12857  hypothetical protein  37.24 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000766125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  34.97 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1507  protein of unknown function DUF150  47.71 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.417111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2203  protein of unknown function DUF150  46.67 
 
 		 173 aa  77.4  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000153569  decreased coverage  0.000471354 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  32.89 
 
 		 153 aa  77  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1208  protein of unknown function DUF150  40.54 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0220811  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  36.6 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  39.39 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  36.6 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  41.11 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  33.57 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  41.11 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  41.11 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  42.22 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  42.22 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  29.94 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  42.22 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  42.22 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  32.14 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  33.57 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  40.59 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  32.91 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  29.33 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  32.67 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  41.11 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  41.11 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1440  protein of unknown function DUF150  44.07 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.626738 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  38.3 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  40.91 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  32.87 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  41.38 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  31.47 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1017  protein of unknown function DUF150  34.87 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  31.47 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  31.47 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  29.11 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  38.78 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  40.23 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  35.79 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1307  protein of unknown function DUF150  35.66 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06980  hypothetical protein  41.01 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.106451  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10290  hypothetical protein  35.22 
 
 		 220 aa  67.4  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  30.77 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  30.77 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  30.77 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  30.77 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  30.77 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  31.88 
 
 		 157 aa  67  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  37.76 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  33.57 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11450  hypothetical protein  36.89 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0199556  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  32.17 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  32.17 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  32.17 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  32.17 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  32.17 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  39.81 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  32.17 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  32.17 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  30.77 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  32.17 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  38.61 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0665  hypothetical protein  28.78 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658224 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  30.97 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  40 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  40.2 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  40.2 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  31.79 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  31.47 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  30.97 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4219  hypothetical protein  37 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000438537  normal  0.129114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>