39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1329 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1329  TM helix repeat-containing protein  100 
 
 		 297 aa  573  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00100917  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16810  hypothetical protein  46.22 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0517  hypothetical protein  47.71 
 
 		 275 aa  175  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.328951  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1737  TM helix repeat-containing protein  47.37 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.5984  decreased coverage  0.000938993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1751  TM helix repeat-containing protein  48.18 
 
 		 287 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.232886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1787  TM helix repeat-containing protein  46.51 
 
 		 335 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1740  TM helix protein  46.51 
 
 		 335 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1719  TM helix repeat-containing protein  46.51 
 
 		 335 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.082128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5533  TM helix repeat-containing protein  43.7 
 
 		 272 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  0.837846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3828  Conserved TM helix repeat-containing protein  41.49 
 
 		 265 aa  152  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.222399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5911  TM helix repeat-containing protein  40.85 
 
 		 279 aa  125  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0074  hypothetical protein  36.53 
 
 		 358 aa  102  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7234  hypothetical protein  36.49 
 
 		 460 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.273739  normal  0.522383 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1406  TM helix protein  27.21 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0345535  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1981  TM helix repeat-containing protein  28.38 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2159  TM helix protein  26.52 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.760211  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2021  TM helix repeat-containing protein  34.22 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1684  TM helix repeat-containing protein  27.27 
 
 		 499 aa  49.7  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2632  TM helix repeat-containing protein  31.74 
 
 		 273 aa  49.3  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.225391  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4747  TM helix repeat-containing protein  24.24 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00173258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2407  TM helix protein  25.18 
 
 		 565 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1056  TM helix repeat-containing protein  27.48 
 
 		 229 aa  47  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0376279  normal  0.186599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3213  TM helix protein  34.55 
 
 		 486 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.529906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0500  TM helix protein  25.71 
 
 		 547 aa  46.6  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587519  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2091  hypothetical protein  24.46 
 
 		 582 aa  45.8  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.395964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1775  TM helix protein  33.33 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2078  TM helix protein  22.03 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1704  TM helix repeat-containing protein  29.17 
 
 		 228 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0127  TM helix repeat-containing protein  31.71 
 
 		 487 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2928  TM helix protein  31.71 
 
 		 487 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606719  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1605  TM helix repeat-containing protein  36.7 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00681338  decreased coverage  0.000000000154997 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0909  TM helix repeat-containing protein  21.69 
 
 		 271 aa  43.5  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1708  TM helix protein  32.04 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0232168  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1598  TM helix repeat-containing protein  38.53 
 
 		 274 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0082628  hitchhiker  0.00441813 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0141  TM helix repeat-containing protein  31.71 
 
 		 487 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23310  Mechanosensitive ion channel protein  31.53 
 
 		 274 aa  42.7  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3653  TM helix repeat-containing protein  36.7 
 
 		 274 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0445182  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2087  TM helix repeat-containing protein  36.7 
 
 		 274 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245727  normal  0.0375248 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0961  hypothetical protein  27.54 
 
 		 274 aa  42.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>