180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0803 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0803  Fumarylacetoacetase  100 
 
 
403 aa  783    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.394865  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0706  fumarylacetoacetase  50.99 
 
 
423 aa  350  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1916  fumarylacetoacetase  51.12 
 
 
397 aa  350  3e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00439783  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6470  fumarylacetoacetase  49.12 
 
 
404 aa  348  8e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8847  Fumarylacetoacetase  52.48 
 
 
378 aa  338  7e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.768181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1686  fumarylacetoacetase  48.53 
 
 
413 aa  337  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4256  fumarylacetoacetase  52.63 
 
 
398 aa  333  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0938214 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1109  fumarylacetoacetase  50.38 
 
 
394 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.242132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3789  fumarylacetoacetase  51.87 
 
 
398 aa  332  7.000000000000001e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10630  fumarylacetoacetate hydrolase  48.42 
 
 
412 aa  328  9e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0499579  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1870  fumarylacetoacetase  48.42 
 
 
405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335153  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07020  fumarylacetoacetate hydrolase  48.46 
 
 
394 aa  323  3e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.257366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0090  Fumarylacetoacetase  51.89 
 
 
394 aa  320  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0655  fumarylacetoacetate hydrolase  50.37 
 
 
391 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4686  fumarylacetoacetase  50.75 
 
 
398 aa  318  9e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.454046  normal  0.30172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0529  fumarylacetoacetase  52.94 
 
 
401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18890  fumarylacetoacetate hydrolase  45.09 
 
 
412 aa  292  7e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0251227  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3806  fumarylacetoacetase  42.96 
 
 
415 aa  277  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.020804  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3924  fumarylacetoacetate hydrolase  42 
 
 
422 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1081  fumarylacetoacetase  41.9 
 
 
420 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.075804  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4375  fumarylacetoacetase  40.67 
 
 
420 aa  252  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00028234  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5151  fumarylacetoacetase  40 
 
 
422 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389186  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0719  fumarylacetoacetase  39.9 
 
 
434 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.118527  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2434  fumarylacetoacetase  38.53 
 
 
436 aa  246  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0470374  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3463  fumarylacetoacetase  41.25 
 
 
423 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.211156 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4535  fumarylacetoacetase  41.25 
 
 
423 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113775  normal  0.91176 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6317  fumarylacetoacetase  42.44 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3899  fumarylacetoacetate hydrolase  38.54 
 
 
436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0338  fumarylacetoacetase  39.66 
 
 
434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0702  fumarylacetoacetase  39.66 
 
 
434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0821  fumarylacetoacetase  39.66 
 
 
434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.386558  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3411  fumarylacetoacetase  35.17 
 
 
427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0790  fumarylacetoacetase  39.66 
 
 
434 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0926  fumarylacetoacetase  37.59 
 
 
433 aa  243  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.523606  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1398  fumarylacetoacetase  38.9 
 
 
435 aa  242  7e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0909  fumarylacetoacetase  39.52 
 
 
422 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3914  fumarylacetoacetate hydrolase  38.42 
 
 
434 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01759  fumarylacetoacetase  40 
 
 
423 aa  240  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.25081 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0781  fumarylacetoacetase  37.14 
 
 
436 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477109  normal  0.394734 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4620  fumarylacetoacetase  38.86 
 
 
430 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4604  fumarylacetoacetase  39.1 
 
 
430 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00921508  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0567  fumarylacetoacetate hydrolase  39.66 
 
 
424 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4480  fumarylacetoacetase  38.86 
 
 
430 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1020  fumarylacetoacetase  38.55 
 
 
422 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.406627  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09238  Fumarylacetoacetase  34.38 
 
 
427 aa  236  6e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0394103  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1558  fumarylacetoacetase  33.97 
 
 
429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0952524  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0287  fumarylacetoacetase  38.94 
 
 
424 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1038  fumarylacetoacetase  36.45 
 
 
429 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.318112  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2055  fumarylacetoacetase  41.86 
 
 
449 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3863  fumarylacetoacetate hydrolase  39.24 
 
 
426 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3212  fumarylacetoacetase  41.86 
 
 
435 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0857  fumarylacetoacetase  41.86 
 
 
435 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.3577  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2689  fumarylacetoacetase  41.86 
 
 
435 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.705809  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1920  fumarylacetoacetase  41.86 
 
 
435 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.882274  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3173  fumarylacetoacetase  41.57 
 
 
449 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3227  fumarylacetoacetase  41.74 
 
 
886 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2562  fumarylacetoacetase  40.39 
 
 
434 aa  232  9e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4887  fumarylacetoacetase  39.48 
 
 
432 aa  232  9e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2622  fumarylacetoacetate hydrolase  37.44 
 
 
418 aa  231  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.817563 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3548  fumarylacetoacetase  38.42 
 
 
401 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.787467  normal  0.296952 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38530  fumarylacetoacetase  38.41 
 
 
432 aa  229  9e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000507003  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3281  fumarylacetoacetase  38.41 
 
 
432 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948022  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2007  fumarylacetoacetate hydrolase  38.57 
 
 
429 aa  227  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79989  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0256  fumarylacetoacetate hydrolase  39.28 
 
 
421 aa  227  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0911  fumarylacetoacetate hydrolase  37.32 
 
 
434 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0818  fumarylacetoacetase  38.15 
 
 
430 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1685  fumarylacetoacetase  38.94 
 
 
429 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3811  fumarylacetoacetase  44.63 
 
 
413 aa  222  8e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.685186  normal  0.278222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2109  fumarylacetoacetase  35.44 
 
 
413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0101993  normal  0.602779 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0709  fumarylacetoacetase  38.64 
 
 
438 aa  220  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.981478 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3550  fumarylacetoacetase  37.83 
 
 
431 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.78252  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3332  fumarylacetoacetase  38.93 
 
 
438 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2533  fumarylacetoacetase  42.02 
 
 
436 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0892  fumarylacetoacetase  44.37 
 
 
421 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1192  fumarylacetoacetase  43.4 
 
 
435 aa  212  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500062  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1436  fumarylacetoacetate hydrolase  39.88 
 
 
416 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.619546  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2735  fumarylacetoacetase  36.88 
 
 
429 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2463  fumarylacetoacetate hydrolase  37.03 
 
 
431 aa  208  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50190  fumarylacetoacetase  40.56 
 
 
444 aa  209  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2044  fumarylacetoacetase  37.6 
 
 
431 aa  209  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0798972 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2996  fumarylacetoacetate hydrolase  35.87 
 
 
425 aa  208  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.273671 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1045  fumarylacetoacetase  38.17 
 
 
436 aa  207  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4303  fumarylacetoacetase  37.44 
 
 
445 aa  207  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1558  fumarylacetoacetase  37.83 
 
 
431 aa  206  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1118  fumarylacetoacetase  35.92 
 
 
424 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2036  fumarylacetoacetase  39.5 
 
 
438 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94384  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2724  fumarylacetoacetate hydrolase  37.69 
 
 
437 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801091  normal  0.0910704 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3325  fumarylacetoacetase  36.41 
 
 
431 aa  202  8e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.736043  normal  0.102364 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50281  predicted protein  32.91 
 
 
417 aa  197  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0432  fumarylacetoacetase  35.4 
 
 
434 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1123  fumarylacetoacetase  37.62 
 
 
437 aa  193  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0412  fumarylacetoacetase  35.22 
 
 
441 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.784977  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0995  fumarylacetoacetate hydrolase  36.39 
 
 
462 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7461  fumarylacetoacetate hydrolase  36.87 
 
 
440 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239921  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1794  fumarylacetoacetate hydrolase  37.74 
 
 
436 aa  189  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01896  Fumarylacetoacetase (FAA)(EC 3.7.1.2)(Fumarylacetoacetate hydrolase)(Beta-diketonase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00770]  31.09 
 
 
431 aa  187  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5612  fumarylacetoacetase  36.87 
 
 
440 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250904  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5976  fumarylacetoacetase  36.87 
 
 
440 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000358245  decreased coverage  0.000159634 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08108  fumarylacetoacetate hydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05160)  32.43 
 
 
435 aa  186  9e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.54519  normal  0.879203 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2528  fumarylacetoacetate hydrolase  34.73 
 
 
450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.172477 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>