77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3231 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1323  putative ATP-dependent Lon protease  66.13 
 
 		 681 aa  972    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1136  putative ATP-dependent Lon protease  65.35 
 
 		 682 aa  961    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.541958  hitchhiker  0.000000432292 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2752  putative ATP-dependent Lon protease  66.23 
 
 		 682 aa  950    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1077  putative ATP-dependent Lon protease  59.26 
 
 		 681 aa  864    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2236  putative ATP-dependent Lon protease  76.25 
 
 		 682 aa  1119    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000058517 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3231  putative ATP-dependent Lon protease  100 
 
 		 684 aa  1408    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5032  putative ATP-dependent Lon protease  40.74 
 
 		 686 aa  508  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0301  putative ATP-dependent Lon protease  40.9 
 
 		 676 aa  497  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0341  hypothetical protein  39.79 
 
 		 694 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.168371  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1906  ATP-dependent protease La  39.14 
 
 		 687 aa  498  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.672246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2283  ATP-dependent Lon-type protease  40.68 
 
 		 679 aa  488  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2488  ATP-dependent Lon protease  37.83 
 
 		 678 aa  457  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0999  ATP-dependent protease La  37.32 
 
 		 679 aa  454  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.48984  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1126  hypothetical protein  37.22 
 
 		 678 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596948  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2041  ATP-dependent protease La  36.24 
 
 		 684 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_258  ATP-dependent Lon protease  36.84 
 
 		 676 aa  437  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2105  hypothetical protein  38.32 
 
 		 676 aa  437  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2202  hypothetical protein  40.65 
 
 		 670 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1675  hypothetical protein  38 
 
 		 689 aa  349  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.404714  hitchhiker  0.000649266 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0565  hypothetical protein  37.23 
 
 		 686 aa  347  3e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642014  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3729  alkaline phosphatase domain-containing protein  39.53 
 
 		 703 aa  342  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02910  conserved hypothetical protein TIGR02688  40.38 
 
 		 694 aa  338  1.9999999999999998e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000891633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4849  hypothetical protein  38.77 
 
 		 675 aa  305  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895704  normal  0.860028 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1800  ATP-dependent protease La  33.12 
 
 		 469 aa  248  3e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186498  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3353  hypothetical protein  36.3 
 
 		 508 aa  245  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1245  ATP-dependent Lon-type protease  33.77 
 
 		 531 aa  243  7.999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1519  ATP-dependent protease La  33.19 
 
 		 470 aa  218  2e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1063  hypothetical protein  29.2 
 
 		 477 aa  189  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0757607  hitchhiker  0.000125956 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0803  ATP-dependent protease La  29.09 
 
 		 485 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0793  ATP-dependent Lon-type protease-like protein  27.39 
 
 		 485 aa  156  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1754  hypothetical protein  28.74 
 
 		 473 aa  155  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0583  ATP-dependent protease La  26.85 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  25.63 
 
 		 775 aa  62  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  27.03 
 
 		 797 aa  53.5  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  21.93 
 
 		 797 aa  51.6  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.15 
 
 		 786 aa  50.8  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3172  ATP-dependent protease La  26.74 
 
 		 810 aa  50.8  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6716  ATP-dependent protease La  24.64 
 
 		 798 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.902322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  24.23 
 
 		 825 aa  48.1  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  24.3 
 
 		 800 aa  48.1  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  23.2 
 
 		 880 aa  47.8  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  23.08 
 
 		 768 aa  47.8  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0112  ATP-dependent protease La  28.31 
 
 		 820 aa  47  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.187598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0872  ATP-dependent protease La  23.67 
 
 		 788 aa  47.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1146  ATP-dependent protease La  24.1 
 
 		 801 aa  47  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0997  ATP-dependent protease La  23.67 
 
 		 788 aa  47.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000039605 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2338  ATP-dependent protease La  24.85 
 
 		 803 aa  45.8  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0304727  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  19.07 
 
 		 783 aa  45.8  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  25.73 
 
 		 784 aa  45.4  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  25.73 
 
 		 784 aa  45.4  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.15 
 
 		 799 aa  45.8  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.73 
 
 		 784 aa  45.4  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.73 
 
 		 784 aa  45.4  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  26.6 
 
 		 809 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.73 
 
 		 784 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.73 
 
 		 784 aa  45.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.73 
 
 		 784 aa  45.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.73 
 
 		 784 aa  45.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.73 
 
 		 784 aa  45.8  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.73 
 
 		 784 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.73 
 
 		 784 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.73 
 
 		 784 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.73 
 
 		 784 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5717  ATP-dependent protease La  23.6 
 
 		 804 aa  45.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.548129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2032  Lon-A peptidase  25 
 
 		 809 aa  45.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.914021  decreased coverage  0.00112725 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  21.63 
 
 		 810 aa  45.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4373  ATP-dependent protease La  25 
 
 		 816 aa  45.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574007  normal  0.577886 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0952  ATP-dependent protease La  26.95 
 
 		 781 aa  44.7  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18202  predicted protein  22.17 
 
 		 882 aa  44.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.71122  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0694  ATP-dependent protease La  28.3 
 
 		 813 aa  44.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.243071  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2044  Lon-A peptidase  27.38 
 
 		 802 aa  44.3  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl404  class III heat shock DNA-binding ATP dependent Lon protease  23.21 
 
 		 787 aa  44.3  0.008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  21.21 
 
 		 787 aa  43.9  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.15 
 
 		 784 aa  43.9  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  23.11 
 
 		 804 aa  43.9  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2955  ATP-dependent protease La  25 
 
 		 809 aa  43.9  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0653516 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0531  ATP-dependent protease La  23.15 
 
 		 809 aa  43.9  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>