More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0084 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0084  ATP synthase F1, epsilon subunit  100 
 
 
139 aa  270  4e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.78895  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.69 
 
 
132 aa  148  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2136  ATP synthase F1, epsilon subunit  53.64 
 
 
137 aa  130  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.42 
 
 
134 aa  129  1e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4164  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  56 
 
 
133 aa  127  4e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.97005e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3414  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.6 
 
 
133 aa  125  2e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1423  ATP synthase F1, epsilon subunit  50.39 
 
 
137 aa  125  2e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2381  ATP synthase F1, epsilon subunit  51.18 
 
 
137 aa  122  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2756  ATP synthase F1, epsilon subunit  52.99 
 
 
148 aa  120  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4790  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.61 
 
 
132 aa  115  1e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2189  ATP synthase F1, epsilon subunit  46.51 
 
 
134 aa  113  8e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17790  ATP synthase F1, epsilon subunit  50 
 
 
134 aa  112  1e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0565  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.22 
 
 
140 aa  111  4e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5425  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44 
 
 
133 aa  110  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0122155  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4986  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44 
 
 
133 aa  110  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.761733  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5481  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44 
 
 
133 aa  110  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5004  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44 
 
 
133 aa  110  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.72013e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44 
 
 
133 aa  110  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.886017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5154  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.2 
 
 
133 aa  109  1e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  3.34813e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5395  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.2 
 
 
133 aa  109  1e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03867e-36 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5546  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.2 
 
 
133 aa  109  1e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  7.10132e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5525  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.2 
 
 
133 aa  109  1e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  5.24846e-05  hitchhiker  2.27919e-09 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2581  ATP synthase F1, epsilon subunit  50.78 
 
 
134 aa  108  2e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3824  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.67 
 
 
133 aa  108  2e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5102  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.4 
 
 
133 aa  107  4e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2843  ATP synthase F1, epsilon subunit  48.31 
 
 
141 aa  107  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3302  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.56 
 
 
134 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3735  ATP synthase F1, epsilon subunit  42.52 
 
 
139 aa  106  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0539  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.66 
 
 
140 aa  106  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000746068  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4073  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.22 
 
 
136 aa  106  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  1.49608e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0273  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.8 
 
 
134 aa  104  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.16135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2161  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.41 
 
 
133 aa  104  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0062  ATP synthase F1, epsilon subunit  50.4 
 
 
140 aa  104  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.59 
 
 
134 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2451  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.41 
 
 
133 aa  104  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4034  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.45 
 
 
138 aa  104  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13371e-05 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4195  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.67 
 
 
140 aa  103  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3949  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.7 
 
 
138 aa  103  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4461  ATP synthase F1, epsilon subunit  42.75 
 
 
139 aa  102  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.84862e-08 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4190  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.39 
 
 
139 aa  100  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4074  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.39 
 
 
137 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69427  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4133  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.46 
 
 
139 aa  100  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490759  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4254  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.39 
 
 
137 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.39 
 
 
139 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4145  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.39 
 
 
139 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4195  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.39 
 
 
137 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3073  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  47.2 
 
 
140 aa  100  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1508  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.18 
 
 
138 aa  100  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4258  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.15 
 
 
139 aa  100  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46 
 
 
134 aa  100  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5167  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.39 
 
 
139 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0939649 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4331  hypothetical protein  46.28 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132194  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4263  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.39 
 
 
139 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  0.317947 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4236  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.39 
 
 
139 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0009  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.91 
 
 
139 aa  99.4  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4548  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.39 
 
 
139 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3947  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.39 
 
 
139 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4246  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.39 
 
 
139 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.014203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3405  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.4 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03559  hypothetical protein  39.39 
 
 
139 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.772502  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3994  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.15 
 
 
140 aa  99.4  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.305683  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03615  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.39 
 
 
139 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.901981  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4099  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.39 
 
 
139 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.420004 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40 
 
 
141 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40 
 
 
141 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40 
 
 
141 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40 
 
 
141 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40 
 
 
141 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.18 
 
 
138 aa  99.4  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2958  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40 
 
 
141 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0177  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40 
 
 
141 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2138  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.41 
 
 
134 aa  98.2  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2176  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.41 
 
 
134 aa  98.2  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0466412  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002031  ATP synthase epsilon chain  38.06 
 
 
140 aa  97.1  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3307  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3169  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.42 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00353797  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0114  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.67 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.693828  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2211  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.53 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2948  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.62 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.62 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.62 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.62 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.722454 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.62 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0123  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.62 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.62 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.77 
 
 
137 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0532539  normal  0.0655418 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3367  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.55 
 
 
142 aa  95.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.46 
 
 
139 aa  94.4  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.808616 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_504  ATP synthase F1, epsilon subunit  49.22 
 
 
140 aa  94  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115824  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.91 
 
 
142 aa  94  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0052877  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1708  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.86 
 
 
134 aa  94  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239436  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3058  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.31 
 
 
140 aa  93.6  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1695  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.91 
 
 
142 aa  93.6  9e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0607  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.444989  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2529  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.55 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0421  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.94 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.66 
 
 
137 aa  93.2  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.711596  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.31 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3026  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.52 
 
 
141 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0063  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.04 
 
 
140 aa  92  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>