More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3258 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
243 aa  489  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  95.47 
 
 
243 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  93.42 
 
 
243 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0381  metallo-beta-lactamase family protein  60.83 
 
 
246 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1757  metallo-beta-lactamase family protein  60.83 
 
 
246 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0424  metallo-beta-lactamase family protein  60.83 
 
 
246 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1570  metallo-beta-lactamase family protein  60.83 
 
 
246 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1223  metallo-beta-lactamase family protein  60.83 
 
 
246 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2863  metallo-beta-lactamase family protein  60.83 
 
 
246 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  49.57 
 
 
244 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  47.95 
 
 
243 aa  206  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  43.33 
 
 
244 aa  205  5e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  41.49 
 
 
246 aa  194  9e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  46.72 
 
 
488 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  44.54 
 
 
489 aa  190  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  46.96 
 
 
457 aa  189  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  42.19 
 
 
476 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  38.19 
 
 
466 aa  185  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  47.11 
 
 
251 aa  181  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  43.8 
 
 
462 aa  178  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  45.65 
 
 
464 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  38.19 
 
 
464 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  40.32 
 
 
479 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  35.69 
 
 
469 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  39.53 
 
 
480 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  36.96 
 
 
480 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  38.67 
 
 
470 aa  162  4.0000000000000004e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  40.83 
 
 
472 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  37.55 
 
 
484 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  37.92 
 
 
470 aa  158  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  43.38 
 
 
460 aa  158  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  37.65 
 
 
471 aa  158  9e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  37.92 
 
 
469 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.78 
 
 
478 aa  156  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  34.9 
 
 
476 aa  156  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  37.4 
 
 
464 aa  156  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  42.49 
 
 
461 aa  155  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  32.26 
 
 
478 aa  155  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  31.4 
 
 
478 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  31.89 
 
 
444 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.4 
 
 
478 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  31.89 
 
 
444 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.4 
 
 
478 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.92 
 
 
502 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  43.35 
 
 
459 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.4 
 
 
478 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  31.01 
 
 
484 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  31.01 
 
 
484 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  39.39 
 
 
455 aa  150  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  39.39 
 
 
472 aa  149  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  41.36 
 
 
459 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  30.71 
 
 
442 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  40.91 
 
 
459 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  40.91 
 
 
459 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  40.91 
 
 
459 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  39.48 
 
 
459 aa  143  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  33.2 
 
 
471 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
459 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
459 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.05 
 
 
472 aa  134  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  34.47 
 
 
463 aa  131  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  35.9 
 
 
470 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  38.03 
 
 
470 aa  128  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  35.34 
 
 
467 aa  128  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  33.61 
 
 
466 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  34.22 
 
 
471 aa  126  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  33.87 
 
 
470 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.93 
 
 
471 aa  120  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  36.09 
 
 
453 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1046  Rhodanese domain protein  33.47 
 
 
391 aa  118  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3034  beta-lactamase domain protein  35.6 
 
 
382 aa  118  9e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.47 
 
 
471 aa  118  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
470 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2898  beta-lactamase domain protein  33.61 
 
 
375 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  34.91 
 
 
450 aa  116  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  37.28 
 
 
346 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  32.49 
 
 
354 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  29.96 
 
 
444 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2641  beta-lactamase domain protein  37.55 
 
 
379 aa  108  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  30.51 
 
 
442 aa  108  9.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  36.07 
 
 
617 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  30.4 
 
 
456 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0673  metallo-beta-lactamase family protein  32.47 
 
 
376 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00215478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0831  metallo-beta-lactamase family protein  32.9 
 
 
376 aa  105  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00416077  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0739  metallo-beta-lactamase family protein  32.47 
 
 
376 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000119995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0687  metallo-beta-lactamase family protein  32.47 
 
 
376 aa  105  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.879597  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0777  metallo-beta-lactamase family protein  32.47 
 
 
376 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  33.92 
 
 
467 aa  104  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0871  metallo-beta-lactamase family protein  32.47 
 
 
376 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000195083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  37.8 
 
 
451 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  31.91 
 
 
230 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  27.48 
 
 
235 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0938  metallo-beta-lactamase family protein  32.47 
 
 
376 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  27.48 
 
 
235 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0867  metallo-beta-lactamase family protein  32.47 
 
 
376 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  33.19 
 
 
455 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.27 
 
 
456 aa  101  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  33.77 
 
 
220 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  29.57 
 
 
346 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0566  beta-lactamase domain protein  29.96 
 
 
378 aa  99.8  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00148503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>