More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1349 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  100 
 
 
581 aa  1148    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1835  methyltransferase type 12  36.77 
 
 
231 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  43.2 
 
 
229 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  41.28 
 
 
228 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  43.2 
 
 
229 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  40.7 
 
 
229 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  42.6 
 
 
229 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  40.7 
 
 
229 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  40.12 
 
 
229 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  40.12 
 
 
229 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  40.12 
 
 
229 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  40.12 
 
 
229 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  41.42 
 
 
229 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
1340 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
1162 aa  113  7.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
457 aa  114  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  40.96 
 
 
1523 aa  111  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1695  methyltransferase type 11  40.12 
 
 
211 aa  110  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0925048  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  33.73 
 
 
215 aa  105  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  35.83 
 
 
746 aa  104  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2476  methyltransferase type 12  40.51 
 
 
229 aa  104  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 
1523 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2592  methyltransferase type 11  37.82 
 
 
219 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  41.21 
 
 
274 aa  100  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  40.24 
 
 
249 aa  98.6  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1345  hypothetical protein  33.13 
 
 
231 aa  97.8  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3006  methyltransferase type 12  32.54 
 
 
681 aa  95.1  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633739  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2011  hypothetical protein  33.76 
 
 
199 aa  92.8  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.714234 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  40.28 
 
 
1312 aa  90.9  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  41.78 
 
 
1287 aa  90.1  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  37.5 
 
 
217 aa  89.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0299  methionine biosynthesis protein MetW  31.71 
 
 
247 aa  89.4  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.974388  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0312  hypothetical protein  33.18 
 
 
216 aa  88.6  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.121352 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 
996 aa  88.2  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1126  Methyltransferase type 11  38 
 
 
229 aa  84  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 
1256 aa  83.6  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  36.77 
 
 
1314 aa  82  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  34.94 
 
 
785 aa  82  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3087  hypothetical protein  25.5 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123974  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4464  Methyltransferase type 12  40.48 
 
 
543 aa  71.6  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  33.33 
 
 
1608 aa  70.5  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.67 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.28 
 
 
237 aa  67  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.28 
 
 
237 aa  67  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1981  O-antigen methyl transferase, putative  31.31 
 
 
574 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.9515  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3155  putative O-antigen methyl transferase  31.31 
 
 
560 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3095  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.31 
 
 
574 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0932  putative O-antigen methyl transferase  31.31 
 
 
574 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.179107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1843  putative O-antigen methyl transferase  31.31 
 
 
574 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3132  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.31 
 
 
574 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2762  putative O-antigen methyl transferase  31.31 
 
 
574 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.346402  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0661  Methyltransferase type 12  31.58 
 
 
222 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.259712  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0639  Methyltransferase type 12  31.98 
 
 
222 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1478  putative O-antigen methyl transferase  29.8 
 
 
560 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.12 
 
 
232 aa  63.9  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  29.14 
 
 
214 aa  63.9  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
353 aa  63.5  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  29.17 
 
 
353 aa  63.5  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2861  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.48 
 
 
240 aa  63.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0308666  decreased coverage  0.000000000135895 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
386 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1042  hypothetical protein  36.5 
 
 
239 aa  63.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  28.3 
 
 
210 aa  62.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  27.71 
 
 
2401 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5793  Methyltransferase type 11  23.03 
 
 
219 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.52 
 
 
232 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  27.04 
 
 
242 aa  60.8  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.72 
 
 
232 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2906  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.92 
 
 
247 aa  60.8  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  32.91 
 
 
308 aa  60.5  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1190  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
241 aa  60.5  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1113  bifunctional 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase and 2-octaprenyl-6-hydroxy phenol methylase  35.92 
 
 
241 aa  60.5  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.72 
 
 
232 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.54 
 
 
232 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.54 
 
 
232 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.54 
 
 
232 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.73 
 
 
248 aa  60.5  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  28.67 
 
 
292 aa  60.5  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.54 
 
 
232 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.95 
 
 
232 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.95 
 
 
239 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  31.85 
 
 
237 aa  58.9  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  24.58 
 
 
1444 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.52 
 
 
245 aa  59.3  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.9 
 
 
234 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  28.08 
 
 
211 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.95 
 
 
247 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.05 
 
 
229 aa  58.2  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  29.61 
 
 
237 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.78 
 
 
234 aa  57.8  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.93 
 
 
262 aa  57.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.63 
 
 
232 aa  57.4  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.81 
 
 
240 aa  57  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.89 
 
 
247 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  33.98 
 
 
457 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  26.51 
 
 
286 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 
236 aa  55.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.31 
 
 
247 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02124  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 
234 aa  55.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.369264  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
390 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0711  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.86 
 
 
247 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0438785  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>