More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0239 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
310 aa  625  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1089  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.4 
 
 
326 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0645  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.39 
 
 
310 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2258  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.2 
 
 
311 aa  434  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.284821  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0971  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.2 
 
 
311 aa  427  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.74 
 
 
314 aa  427  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209861 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3177  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.1 
 
 
310 aa  425  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4332  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.64 
 
 
314 aa  425  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0649453  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.31 
 
 
314 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.849276  normal  0.673311 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2553  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.1 
 
 
317 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.391347  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3875  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.31 
 
 
346 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.0190503 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2257  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.13 
 
 
310 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441991  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6074  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.99 
 
 
316 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.67 
 
 
314 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1409  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.74 
 
 
317 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70704  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1634  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.13 
 
 
310 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1533  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.13 
 
 
310 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.987838  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.52 
 
 
317 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1482  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.13 
 
 
328 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00949997  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1709  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.52 
 
 
310 aa  416  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347929  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.16 
 
 
310 aa  414  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2165  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.84 
 
 
310 aa  411  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2438  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.49 
 
 
311 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.167005  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0174  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.84 
 
 
310 aa  411  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2763  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.87 
 
 
310 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549676  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3026  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.23 
 
 
310 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.695746  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3879  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.77 
 
 
317 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409064  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2942  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.88 
 
 
311 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4846  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.84 
 
 
317 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.84 
 
 
331 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.19 
 
 
317 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384244  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.9 
 
 
310 aa  399  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0838998  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.19 
 
 
317 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0671  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.14 
 
 
312 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2931  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.68 
 
 
340 aa  368  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.134005  normal  0.0220495 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0759  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.03 
 
 
310 aa  369  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.462965 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1920  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.69 
 
 
321 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3823  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.41 
 
 
339 aa  363  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  59.22 
 
 
312 aa  363  3e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1625  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.03 
 
 
321 aa  362  4e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.765759  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0976  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.41 
 
 
339 aa  359  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.508643  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2301  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  57.41 
 
 
339 aa  359  4e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.320704  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2199  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.41 
 
 
339 aa  358  7e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.31 
 
 
314 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.84 
 
 
342 aa  355  6.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.99 
 
 
314 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5320  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.56 
 
 
313 aa  354  8.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61770  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.56 
 
 
313 aa  354  8.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.701218  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.95 
 
 
316 aa  352  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.97 
 
 
340 aa  352  4e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.63 
 
 
316 aa  351  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.63 
 
 
316 aa  350  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1104  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.91 
 
 
313 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.96 
 
 
315 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41520  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.91 
 
 
313 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.684903  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.99 
 
 
314 aa  350  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.96 
 
 
315 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244437  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0722  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.27 
 
 
313 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162348  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.59 
 
 
310 aa  349  4e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.973686  normal  0.13758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0756  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.27 
 
 
310 aa  348  5e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0944  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.59 
 
 
313 aa  348  5e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4461  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.27 
 
 
310 aa  348  5e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.329466  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.27 
 
 
310 aa  348  5e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.84 
 
 
309 aa  348  6e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.84 
 
 
309 aa  348  8e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.84 
 
 
309 aa  348  1e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.59 
 
 
310 aa  347  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00928462  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.57 
 
 
320 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.57 
 
 
320 aa  345  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.57 
 
 
320 aa  345  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  55.16 
 
 
313 aa  345  6e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.17 
 
 
311 aa  345  7e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.57 
 
 
318 aa  344  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.13 
 
 
318 aa  344  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1760  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.49 
 
 
314 aa  344  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290937  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.24 
 
 
318 aa  344  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.63 
 
 
314 aa  343  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.91 
 
 
320 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.91 
 
 
320 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6132  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.13 
 
 
320 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000299156  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0283  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.27 
 
 
318 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.69 
 
 
314 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.9 
 
 
320 aa  342  4e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.9 
 
 
309 aa  342  5.999999999999999e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.72 
 
 
316 aa  341  7e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.87 
 
 
319 aa  341  7e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.25 
 
 
318 aa  341  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.87 
 
 
321 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0289  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.93 
 
 
317 aa  341  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.99 
 
 
311 aa  341  1e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.93 
 
 
316 aa  340  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2365  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.41 
 
 
316 aa  340  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.19 
 
 
315 aa  340  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00259725  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.58 
 
 
318 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.58 
 
 
318 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.58 
 
 
318 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.58 
 
 
318 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0589  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.08 
 
 
316 aa  339  4e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.58 
 
 
318 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.59 
 
 
318 aa  339  4e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>