More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_3021 on replicon NC_013206
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013206  Aaci_3021  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 91 aa  182  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  56.67 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  56.67 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  56.67 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  56.67 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  56.67 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  56.67 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  56.67 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  56.67 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  56.67 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  115  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  58.62 
 
 		 90 aa  113  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0074  DNA-binding protein HU  58.89 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000000481156  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000668206  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  52.81 
 
 		 91 aa  107  6e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  55.06 
 
 		 91 aa  107  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  51.69 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  51.11 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1175  histone-like DNA-binding protein  55.06 
 
 		 91 aa  105  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000211181  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  51.69 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 91 aa  103  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0083  DNA-binding protein HU (DNA-binding protein II)  51.69 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  51.69 
 
 		 91 aa  103  8e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  103  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  53.33 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0183  DNA-binding protein HU 1  54.44 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000296943  hitchhiker  2.26878e-36 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  55.06 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0184  DNA-binding protein HU 1  53.33 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 91 aa  100  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 92 aa  98.6  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006954  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 95 aa  97.4  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2802  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 91 aa  97.4  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000141643  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2488  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 91 aa  97.4  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000405619  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0010  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 91 aa  97.1  7e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649518  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 91 aa  97.1  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1551  histone-like DNA-binding protein  51.11 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00525571  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0219  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 96 aa  94.7  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.132966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  47.78 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 95 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3398  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 92 aa  94  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000223697  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  47.25 
 
 		 95 aa  94  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0429  histone family protein DNA-binding protein  49.45 
 
 		 92 aa  94  7e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00929572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2602  DNA-binding protein HU  48.35 
 
 		 96 aa  92.8  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717937  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0187  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 93 aa  93.2  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4105  nucleoid protein Hbs  45.56 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1514  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 91 aa  92  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000108882  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1886  integration host factor, alpha subunit  45.05 
 
 		 99 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.067674 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0600  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0791658  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10570  histone family protein DNA-binding protein  44.9 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4159  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3213  histone-like DNA-binding protein  42.22 
 
 		 91 aa  92  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1553  histone-like DNA-binding protein  45.56 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0022  DNA-binding protein HU  44.44 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00102315  hitchhiker  0.000567997 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0579  histone-like DNA-binding protein  48.89 
 
 		 91 aa  91.3  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.410031  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2092  nucleoid protein Hbs  48.89 
 
 		 91 aa  91.3  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_28  DNA-binding protein HU-alpha  44.44 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1909  integration host factor subunit alpha  44.44 
 
 		 113 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0628  histone-like DNA-binding protein  52.22 
 
 		 93 aa  90.9  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1969  integration host factor subunit alpha  44.44 
 
 		 113 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0019696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1994  integration host factor subunit alpha  44.44 
 
 		 113 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1910  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 90 aa  91.3  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000311196  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0505  DNA-binding protein HU  53.93 
 
 		 91 aa  90.5  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000181795  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13741  histone-like DNA-binding protein  48.89 
 
 		 92 aa  90.5  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0648  non-specific DNA-binding protein HBsu  47.06 
 
 		 110 aa  90.5  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.271458  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  41.38 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_007949  Bpro_4958  histone-like DNA-binding protein  50.56 
 
 		 103 aa  90.1  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.674818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1941  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 91 aa  90.1  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1108  nucleoid protein Hbs  45.56 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0932961  normal  0.770831 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05711  histone-like DNA-binding protein  46.67 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>