146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1563 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1563  HNH endonuclease  100 
 
 
362 aa  716    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.010402  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1468  HNH nuclease  86.5 
 
 
362 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.09392  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1255  HNH nuclease  77.84 
 
 
392 aa  548  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4158  HNH nuclease  78.14 
 
 
359 aa  548  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3349  HNH endonuclease  77.9 
 
 
368 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.645482  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3618  HNH nuclease  77.87 
 
 
368 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4185  HNH nuclease  79.72 
 
 
357 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0908  HNH nuclease  77.87 
 
 
370 aa  541  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0904  HNH nuclease  80 
 
 
370 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590201  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4134  HNH nuclease  77.9 
 
 
361 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.276334  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1150  HNH nuclease  73.8 
 
 
374 aa  537  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3119  HNH nuclease  78.9 
 
 
357 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.134297  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4018  HNH endonuclease  76.78 
 
 
357 aa  535  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1371  HNH nuclease  80.11 
 
 
373 aa  535  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3430  HNH nuclease  75.13 
 
 
379 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4042  HNH endonuclease  79.94 
 
 
356 aa  532  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00210589  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4160  HNH nuclease  75.2 
 
 
358 aa  531  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.874339  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0859  HNH nuclease  79.73 
 
 
370 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0115605  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3550  HNH nuclease  79.39 
 
 
416 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00633328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1342  HNH nuclease  78.05 
 
 
382 aa  521  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.435035  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3934  HNH nuclease  75.35 
 
 
420 aa  514  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4076  HNH endonuclease  79.21 
 
 
407 aa  514  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.39422  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3494  HNH nuclease  74.06 
 
 
355 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4159  HNH endonuclease  74.36 
 
 
334 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114592  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4239  HNH endonuclease  53.62 
 
 
372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0816  HNH endonuclease  51.55 
 
 
355 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.266631 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4259  HNH nuclease  51.65 
 
 
346 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2900  HNH endonuclease  52.85 
 
 
336 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0011728 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4262  HNH endonuclease  52.41 
 
 
372 aa  309  4e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3987  HNH endonuclease  48.33 
 
 
359 aa  302  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4129  HNH endonuclease  48.78 
 
 
386 aa  291  8e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4128  HNH endonuclease  50 
 
 
334 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4099  HNH endonuclease  47.57 
 
 
384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4281  HNH endonuclease  47.53 
 
 
357 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2115  HNH endonuclease  46.83 
 
 
322 aa  275  7e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1760  HNH endonuclease  46.02 
 
 
387 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3020  hypothetical protein  87.32 
 
 
160 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.765456  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1468  HNH nuclease  84.38 
 
 
179 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0419266  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0411  HNH endonuclease  35.12 
 
 
391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.732707 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0998  HNH endonuclease  33.96 
 
 
387 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.638291  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1449  HNH endonuclease  34.34 
 
 
391 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.964003  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1700  HNH endonuclease  34.5 
 
 
388 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00106635  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1431  HNH endonuclease  34.57 
 
 
388 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.535031  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3075  HNH endonuclease  33.97 
 
 
391 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00244275  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3198  HNH endonuclease  34.69 
 
 
388 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3400  HNH endonuclease  34.23 
 
 
390 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00340791  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1516  HNH endonuclease  33.77 
 
 
390 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000144845  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4158  HNH endonuclease  34.33 
 
 
388 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3850  HNH endonuclease  34.1 
 
 
461 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0451  hypothetical protein  43.2 
 
 
249 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.446853 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0450  HNH endonuclease  33.56 
 
 
390 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.480855 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2146  hypothetical protein  33.88 
 
 
414 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.585384  normal  0.0437716 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3039  HNH endonuclease  38.8 
 
 
309 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.572998  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3791  HNH endonuclease  40.4 
 
 
362 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.352304 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1632  HNH endonuclease  40.25 
 
 
388 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.437118  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1332  HNH endonuclease  38.65 
 
 
264 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146487  normal  0.232691 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1300  HNH endonuclease  39.87 
 
 
316 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409984  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0344  HNH endonuclease  55.26 
 
 
188 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557879  normal  0.69024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3022  HNH endonuclease  43.12 
 
 
308 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2410  HNH endonuclease  41.28 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3738  hypothetical protein  43.02 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.381114  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  44.78 
 
 
560 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  41.18 
 
 
321 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0461  HNH endonuclease  42.65 
 
 
206 aa  63.2  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0161278  hitchhiker  0.0046419 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  42.47 
 
 
177 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1080  HNH endonuclease  34.52 
 
 
228 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0178518  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0876  HNH nuclease  44.32 
 
 
218 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1269  HNH endonuclease domain-containing protein  37.5 
 
 
232 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000309683  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  38.67 
 
 
169 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0855  HNH endonuclease  36.23 
 
 
230 aa  55.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000164704  hitchhiker  0.000000000578298 
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  27.93 
 
 
190 aa  54.3  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1591  HNH endonuclease family protein  27.93 
 
 
190 aa  53.1  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  35.06 
 
 
189 aa  53.1  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  36.99 
 
 
169 aa  53.1  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  37.5 
 
 
171 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1272  HNH endonuclease  27.93 
 
 
190 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  36 
 
 
196 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  33.73 
 
 
186 aa  50.4  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  35.35 
 
 
178 aa  50.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  39.39 
 
 
181 aa  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  49.7  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  39.13 
 
 
182 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  30.48 
 
 
163 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  33.33 
 
 
169 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  40.98 
 
 
166 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  32.14 
 
 
205 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  33.33 
 
 
216 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  35.44 
 
 
189 aa  48.9  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  39.13 
 
 
182 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  34.29 
 
 
185 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  43.14 
 
 
162 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  39.13 
 
 
182 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  37.33 
 
 
182 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  34.78 
 
 
191 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0579  HNH endonuclease  50 
 
 
123 aa  47.4  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  31.94 
 
 
185 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  34.88 
 
 
186 aa  47.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  36 
 
 
197 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  30.56 
 
 
186 aa  47.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  34.94 
 
 
183 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>