1079 genes were found for organism Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 11    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Bcenmc03_6016  CDS  NC_010512  330  707  +  378  LysR family transcriptional regulator  YP_001773632  normal  0.234524  normal  0.324273  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6017  CDS  NC_010512  704  1156  +  453  phosphate-starvation-inducible E  YP_001773633  normal  0.134079  normal  0.333922  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6018  CDS  NC_010512  1244  1699  +  456  membrane protein  YP_001773634  normal  0.270475  normal  0.436917  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6019  CDS  NC_010512  1734  1982  +  249  hypothetical protein  YP_001773635  normal  0.274384  normal  0.411432  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6020  CDS  NC_010512  2361  3785  +  1425  transcriptional regulator  YP_001773636  normal  0.492916  normal  0.125321  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6021  CDS  NC_010512  3813  4973  -  1161  formate dehydrogenase  YP_001773637  normal  1  normal  0.0478753  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6022  CDS  NC_010512  5206  6735  +  1530  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_001773638  normal  1  normal  0.0194312  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6023  CDS  NC_010512  6778  7155  +  378  hypothetical protein  YP_001773639  normal  1  normal  0.0245572  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6024  CDS  NC_010512  7205  7423  -  219  hypothetical protein  YP_001773640  normal  1  normal  0.0238074  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6025  CDS  NC_010512  7546  8184  +  639  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  YP_001773641  normal  1  normal  0.0264079  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6026  CDS  NC_010512  8216  8686  +  471  hypothetical protein  YP_001773642  normal  1  normal  0.0614455  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6027  CDS  NC_010512  8826  10031  +  1206  alcohol dehydrogenase  YP_001773643  normal  1  normal  0.16852  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6028  CDS  NC_010512  10067  10390  +  324  hypothetical protein  YP_001773644  normal  1  normal  0.128981  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6029  CDS  NC_010512  10394  11983  -  1590  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  YP_001773645  normal  1  normal  0.17892  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6030  CDS  NC_010512  12241  12603  +  363  hypothetical protein  YP_001773646  normal  1  normal  0.195946  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6031  CDS  NC_010512  12788  13672  +  885  transport-associated  YP_001773647  normal  1  normal  0.237369  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6032  CDS  NC_010512  13720  16521  +  2802  response regulator receiver protein  YP_001773648  normal  0.340327  normal  0.371985  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6033  CDS  NC_010512  16547  16990  +  444  hypothetical protein  YP_001773649  normal  0.156702  normal  0.227762  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6034  CDS  NC_010512  17188  17937  +  750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001773650  normal  0.311099  normal  0.357873  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6035  CDS  NC_010512  17928  18539  +  612  histidinol-phosphate phosphatase family protein  YP_001773651  normal  0.794278  normal  0.350519  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6036  CDS  NC_010512  18536  19741  +  1206  glycosyl transferase family protein  YP_001773652  normal  1  normal  0.424999  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6037  CDS  NC_010512  19745  21490  +  1746  carbamoyltransferase  YP_001773653  normal  1  normal  0.652801  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6038  CDS  NC_010512  21487  22488  +  1002  glycosyl transferase family protein  YP_001773654  normal  1  normal  0.738252  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6039  CDS  NC_010512  22502  23554  -  1053  IS605 family transposase OrfB  YP_001773655  normal  0.767998  normal  0.985629  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6040  CDS  NC_010512  23644  24732  +  1089  glycosyl transferase family protein  YP_001773656  normal  0.511032  normal  0.738252  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6041  CDS  NC_010512  24722  25672  +  951  glycosyl transferase group 1  YP_001773657  normal  0.196578  normal  0.930555  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6042  CDS  NC_010512  25710  26744  -  1035  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  YP_001773658  normal  0.220218  normal  0.564573  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6043  CDS  NC_010512  27076  28443  +  1368  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  YP_001773659  normal  0.174163  normal  0.310936  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6044  CDS  NC_010512  28461  29384  -  924  glycosyl transferase family protein  YP_001773660  normal  0.0866965  normal  0.274179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6045  CDS  NC_010512  29363  30058  -  696  LmbE family protein  YP_001773661  normal  0.048617  normal  0.182794  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6046  CDS  NC_010512  30178  32484  +  2307  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  YP_001773662  normal  0.479069  normal  0.26296  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6047  CDS  NC_010512  32525  33571  -  1047  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_001773663  normal  0.438767  normal  0.0540302  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6048  CDS  NC_010512  33571  34890  -  1320  glycosyl transferase group 1  YP_001773664  normal  1  normal  0.0604596  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6049  CDS  NC_010512  35135  35539  +  405  transport-associated  YP_001773665  normal  1  normal  0.0480722  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6050  CDS  NC_010512  35570  36598  +  1029  short chain dehydrogenase  YP_001773666  normal  1  normal  0.057993  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6051  CDS  NC_010512  36626  36925  +  300  hypothetical protein  YP_001773667  normal  1  normal  0.0458725  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6052  CDS  NC_010512  36987  37553  +  567  hypothetical protein  YP_001773668  normal  1  normal  0.0462597  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6053  CDS  NC_010512  37675  38532  +  858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001773669  normal  1  normal  0.0516293  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6054  CDS  NC_010512  38567  39181  +  615  hypothetical protein  YP_001773670  normal  1  normal  0.127595  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6055  CDS  NC_010512  39241  39852  +  612  hypothetical protein  YP_001773671  normal  0.971023  normal  0.120372  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6056  CDS  NC_010512  39949  41241  -  1293  natural resistance-associated macrophage protein  YP_001773672  normal  1  normal  0.093688  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6057  CDS  NC_010512  41238  41909  -  672  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  YP_001773673  normal  0.632041  normal  0.181537  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6058  CDS  NC_010512  42143  42622  +  480  response regulator receiver protein  YP_001773674  normal  0.68971  normal  0.260625  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6059  CDS  NC_010512  42755  43237  -  483  PRC-barrel domain-containing protein  YP_001773675  normal  1  normal  0.185683  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6060  CDS  NC_010512  43330  43761  -  432  CBS domain-containing protein  YP_001773676  normal  0.613406  normal  0.175834  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6061  CDS  NC_010512  43858  44112  -  255  hypothetical protein  YP_001773677  normal  0.701238  normal  0.166121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6062  CDS  NC_010512  44283  44585  +  303  hypothetical protein  YP_001773678  normal  0.554987  normal  0.162691  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6063  CDS  NC_010512  44785  45033  +  249  hypothetical protein  YP_001773679  normal  0.210552  normal  0.154964  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6064  CDS  NC_010512  45030  45341  +  312  hypothetical protein  YP_001773680  normal  0.224282  normal  0.0677618  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6065  CDS  NC_010512  45390  45704  +  315  hypothetical protein  YP_001773681  normal  0.316845  normal  0.0683418  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6066  CDS  NC_010512  45779  46237  +  459  hypothetical protein  YP_001773682  normal  0.184002  normal  0.0421173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6067  CDS  NC_010512  46523  47956  +  1434  RNA polymerase factor sigma-54  YP_001773683  normal  0.166835  normal  0.0599686  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6068  CDS  NC_010512  48029  48217  +  189  hypothetical protein  YP_001773684  normal  0.242367  normal  0.0702761  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6069  CDS  NC_010512  48264  48425  +  162  hypothetical protein  YP_001773685  normal  0.426031  normal  0.11086  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6070  CDS  NC_010512  48422  48808  +  387  hypothetical protein  YP_001773686  normal  1  normal  0.119016  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6071  CDS  NC_010512  48936  51050  +  2115  hydroperoxidase II  YP_001773687  normal  1  normal  0.176367  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6072  CDS  NC_010512  51153  52172  +  1020  Ku protein  YP_001773688  normal  1  normal  0.0823424  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6073  CDS  NC_010512  52224  55007  +  2784  DNA ligase D  YP_001773689  normal  1  normal  0.0510863  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6074  CDS  NC_010512  55012  56334  -  1323  sodium/hydrogen exchanger  YP_001773690  normal  1  normal  0.0981036  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6075  CDS  NC_010512  56389  56763  -  375  hypothetical protein  YP_001773691  normal  1  normal  0.0756645  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6076  CDS  NC_010512  56921  57370  +  450  hypothetical protein  YP_001773692  normal  0.896655  normal  0.0734914  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6077  CDS  NC_010512  57456  57821  +  366  hypothetical protein  YP_001773693  normal  0.684799  normal  0.0699953  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6078  CDS  NC_010512  58069  58617  +  549  PfpI family intracellular peptidase  YP_001773694  normal  0.87309  normal  0.0714327  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6079  CDS  NC_010512  58622  58957  +  336  hypothetical protein  YP_001773695  normal  1  normal  0.0686391  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6080  CDS  NC_010512  59025  59471  +  447  hypothetical protein  YP_001773696  normal  1  normal  0.0723054  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6081  CDS  NC_010512  59494  60744  -  1251  phosphatidylserine decarboxylase-related  YP_001773697  normal  1  normal  0.134121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6082  CDS  NC_010512  61278  64046  -  2769  malto-oligosyltrehalose synthase  YP_001773698  normal  1  normal  0.292692  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6083  CDS  NC_010512  64043  66232  -  2190  4-alpha-glucanotransferase  YP_001773699  normal  1  normal  0.309895  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6084  CDS  NC_010512  66229  68100  -  1872  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  YP_001773700  normal  0.0800563  normal  0.517513  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6085  CDS  NC_010512  68109  70226  -  2118  glycogen debranching enzyme GlgX  YP_001773701  normal  0.0291933  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6086  CDS  NC_010512  70259  72469  -  2211  glycogen branching enzyme  YP_001773702  normal  0.133555  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6087  CDS  NC_010512  72466  75879  -  3414  trehalose synthase  YP_001773703  normal  0.0830562  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6088  CDS  NC_010512  75876  79268  -  3393  alpha amylase catalytic region  YP_001773704  normal  0.984614  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6089  CDS  NC_010512  79425  79913  -  489  hypothetical protein  YP_001773705  normal  0.109506  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6090  CDS  NC_010512  79943  80719  -  777  endonuclease/exonuclease/phosphatase  YP_001773706  normal  0.18128  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6091  CDS  NC_010512  80710  82908  -  2199  SNARE associated Golgi protein  YP_001773707  normal  0.123447  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6092  CDS  NC_010512  82905  83228  -  324  hypothetical protein  YP_001773708  normal  0.419182  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6093  CDS  NC_010512  83225  83929  -  705  MgtC/SapB transporter  YP_001773709  normal  0.867489  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6094  CDS  NC_010512  84047  84340  +  294  hypothetical protein  YP_001773710  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6095  CDS  NC_010512  84433  85140  +  708  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  YP_001773711  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6096  CDS  NC_010512  85171  85602  -  432  hypothetical protein  YP_001773712  normal  0.67799  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6097  CDS  NC_010512  85578  86861  -  1284  hypothetical protein  YP_001773713  normal  0.901911  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6098  CDS  NC_010512  87684  88736  -  1053  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  YP_001773714  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6099  CDS  NC_010512  88733  89788  -  1056  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  YP_001773715  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6100  CDS  NC_010512  89801  90895  -  1095  methyltransferase type 12  YP_001773716  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6101  CDS  NC_010512  90909  91871  -  963  methyltransferase type 11  YP_001773717  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6102  CDS  NC_010512  92504  93178  -  675  HAD family hydrolase  YP_001773718  normal  0.524869  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6103  CDS  NC_010512  93382  94584  +  1203  sugar efflux transporter  YP_001773719  normal  0.542417  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6104  CDS  NC_010512  94613  95389  -  777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001773720  normal  0.500717  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6105  CDS  NC_010512  95548  96450  +  903  LysR family transcriptional regulator  YP_001773721  normal  0.336875  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6106  CDS  NC_010512  96759  97712  +  954  putative transmembrane sensor  YP_001773722  normal  0.655193  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6107  CDS  NC_010512  97848  98312  +  465  AsnC family transcriptional regulator  YP_001773723  normal  0.352577  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6108  CDS  NC_010512  98608  100998  +  2391  TonB-dependent siderophore receptor  YP_001773724  normal  0.296471  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6109  CDS  NC_010512  100988  101776  +  789  TonB family protein  YP_001773725  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6110  CDS  NC_010512  101800  102540  +  741  MotA/TolQ/ExbB proton channel  YP_001773726  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6111  CDS  NC_010512  102552  102974  +  423  biopolymer transport protein ExbD/TolR  YP_001773727  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6112  CDS  NC_010512  102971  104782  +  1812  ABC transporter  YP_001773728  normal  0.863799  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6113  CDS  NC_010512  104861  106081  +  1221  thioredoxin  YP_001773729  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6114  CDS  NC_010512  106305  107663  +  1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  YP_001773730  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6115  CDS  NC_010512  107713  109200  +  1488  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  YP_001773731  normal  1  normal  1  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 11    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>