14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6097 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6097  hypothetical protein  100 
 
 
427 aa  883    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901911  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0166  hypothetical protein  42.79 
 
 
436 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4053  hypothetical protein  43.79 
 
 
407 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.838771  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1775  hypothetical protein  30.9 
 
 
396 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.062181 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1608  hypothetical protein  36.42 
 
 
150 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292342  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3853  hypothetical protein  27.03 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351938  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1603  hypothetical protein  32.95 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0990  hypothetical protein  25.72 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.677101  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1107  hypothetical protein  23.81 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0283208  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4707  hypothetical protein  24.32 
 
 
289 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2561  hypothetical protein  24.21 
 
 
296 aa  63.5  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5645  hypothetical protein  24.78 
 
 
312 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3187  hypothetical protein  37.14 
 
 
161 aa  46.6  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4334  hypothetical protein  32.05 
 
 
194 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.468137 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>