19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4707 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4707  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  597  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0990  hypothetical protein  61.48 
 
 
293 aa  349  4e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.677101  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1107  hypothetical protein  58.25 
 
 
318 aa  330  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0283208  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3853  hypothetical protein  52.1 
 
 
302 aa  301  6.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351938  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3187  hypothetical protein  71.52 
 
 
161 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4334  hypothetical protein  59.74 
 
 
194 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.468137 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3190  hypothetical protein  60.15 
 
 
146 aa  165  8e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4335  hypothetical protein  50 
 
 
140 aa  135  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525857  normal  0.453219 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0478  hypothetical protein  37.78 
 
 
308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00102471  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5645  hypothetical protein  29.69 
 
 
312 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2561  hypothetical protein  32.62 
 
 
296 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1775  hypothetical protein  27.04 
 
 
396 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.062181 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0166  hypothetical protein  24.93 
 
 
436 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6097  hypothetical protein  24.32 
 
 
427 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901911  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1608  hypothetical protein  31.03 
 
 
150 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292342  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1102  hypothetical protein  52.38 
 
 
92 aa  52.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4053  hypothetical protein  23.96 
 
 
407 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.838771  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1603  hypothetical protein  35.16 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3775  hypothetical protein  52.27 
 
 
94 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>