13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4335 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4335  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  295  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525857  normal  0.453219 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3853  hypothetical protein  59.85 
 
 
302 aa  178  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351938  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1107  hypothetical protein  57.97 
 
 
318 aa  176  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0283208  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4707  hypothetical protein  50 
 
 
289 aa  135  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0990  hypothetical protein  50.36 
 
 
293 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.677101  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3190  hypothetical protein  52.38 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5645  hypothetical protein  30.99 
 
 
312 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2561  hypothetical protein  35.77 
 
 
296 aa  61.2  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1775  hypothetical protein  31.06 
 
 
396 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.062181 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1102  hypothetical protein  59.09 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1608  hypothetical protein  28.1 
 
 
150 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292342  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0478  hypothetical protein  31.67 
 
 
308 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00102471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0166  hypothetical protein  27.13 
 
 
436 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.539616 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>