13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3190 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3190  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  304  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0990  hypothetical protein  80.92 
 
 		 293 aa  226  7e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.677101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4707  hypothetical protein  60.15 
 
 		 289 aa  165  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3853  hypothetical protein  55.3 
 
 		 302 aa  154  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1107  hypothetical protein  54.55 
 
 		 318 aa  149  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0283208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4335  hypothetical protein  52.38 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525857  normal  0.453219 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5645  hypothetical protein  31.13 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1775  hypothetical protein  34.48 
 
 		 396 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.062181 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2561  hypothetical protein  28.78 
 
 		 296 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0478  hypothetical protein  37.23 
 
 		 308 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00102471  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1102  hypothetical protein  59.46 
 
 		 92 aa  57  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1608  hypothetical protein  28.47 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0166  hypothetical protein  26.16 
 
 		 436 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.539616 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>