16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0478 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0478  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  644    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00102471  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3775  hypothetical protein  90.32 
 
 		 94 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2561  hypothetical protein  32.64 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4707  hypothetical protein  37.78 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0990  hypothetical protein  32.5 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.677101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1107  hypothetical protein  31.23 
 
 		 318 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0283208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3853  hypothetical protein  31.56 
 
 		 302 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5645  hypothetical protein  27.21 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3187  hypothetical protein  34.93 
 
 		 161 aa  91.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4334  hypothetical protein  35.66 
 
 		 194 aa  89  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.468137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1775  hypothetical protein  24.43 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.062181 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3190  hypothetical protein  37.23 
 
 		 146 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4053  hypothetical protein  22.56 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.838771  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0166  hypothetical protein  22.04 
 
 		 436 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4335  hypothetical protein  31.67 
 
 		 140 aa  49.3  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525857  normal  0.453219 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6097  hypothetical protein  23.56 
 
 		 427 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901911  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>