19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2561 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2561  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  609  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0159  hypothetical protein  74.44 
 
 
105 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0478  hypothetical protein  33.33 
 
 
308 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00102471  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0990  hypothetical protein  32.83 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.677101  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3853  hypothetical protein  31.64 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351938  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1107  hypothetical protein  32.97 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0283208  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4707  hypothetical protein  32.62 
 
 
289 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5645  hypothetical protein  28.34 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4334  hypothetical protein  32.12 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.468137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1775  hypothetical protein  27.52 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.062181 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0166  hypothetical protein  25.51 
 
 
436 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3190  hypothetical protein  28.78 
 
 
146 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4053  hypothetical protein  24.01 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.838771  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6097  hypothetical protein  23.9 
 
 
427 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901911  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4335  hypothetical protein  35.77 
 
 
140 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525857  normal  0.453219 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3187  hypothetical protein  30.5 
 
 
161 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1608  hypothetical protein  29.93 
 
 
150 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292342  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1603  hypothetical protein  29.29 
 
 
262 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2531  siderophore synthetase component-like protein  22.96 
 
 
407 aa  42.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11566  normal  0.232038 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>