17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6018 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6018  membrane protein  100 
 
 		 151 aa  291  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.270475  normal  0.436917 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1401  membrane protein  98.68 
 
 		 151 aa  288  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6428  membrane protein  98.68 
 
 		 151 aa  288  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.3796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7004  membrane protein  92.72 
 
 		 151 aa  202  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.942159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5663  membrane protein  83.33 
 
 		 151 aa  193  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.88502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6411  membrane protein  82 
 
 		 151 aa  187  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.475674  normal  0.162547 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5417  membrane protein  79 
 
 		 101 aa  88.2  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.711209  normal  0.0915439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5486  membrane protein of uknown function UCP014873  30.92 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648729  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2386  hypothetical protein  30.77 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1480  hypothetical protein  29.86 
 
 		 301 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0592  hypothetical protein  38.81 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6898  hypothetical protein  29.61 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0308  hypothetical protein  30.95 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0336  hypothetical protein  30.95 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3781  membrane protein of uknown function UCP014873  30.51 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.579535 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0847  membrane protein-like  35.14 
 
 		 255 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4746  membrane protein of uknown function UCP014873  31.13 
 
 		 168 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>