16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7004 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7004  membrane protein  100 
 
 
151 aa  291  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.942159  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1401  membrane protein  92.72 
 
 
151 aa  199  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6428  membrane protein  92.72 
 
 
151 aa  199  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.3796  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6018  membrane protein  92.72 
 
 
151 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.270475  normal  0.436917 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5663  membrane protein  82.67 
 
 
151 aa  185  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.88502  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6411  membrane protein  81.33 
 
 
151 aa  180  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.475674  normal  0.162547 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5417  membrane protein  78 
 
 
101 aa  84  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.711209  normal  0.0915439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5486  membrane protein of uknown function UCP014873  31.58 
 
 
176 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648729  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2386  hypothetical protein  30.41 
 
 
166 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1480  hypothetical protein  32.19 
 
 
301 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0592  hypothetical protein  37.5 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6898  hypothetical protein  29.61 
 
 
176 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4746  membrane protein of uknown function UCP014873  29.53 
 
 
168 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3781  membrane protein of uknown function UCP014873  29.03 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.579535 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0336  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0308  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>