15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5663 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5663  membrane protein  100 
 
 		 151 aa  288  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.88502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6411  membrane protein  97.35 
 
 		 151 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.475674  normal  0.162547 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6018  membrane protein  83.33 
 
 		 151 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.270475  normal  0.436917 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1401  membrane protein  82.67 
 
 		 151 aa  176  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6428  membrane protein  82.67 
 
 		 151 aa  176  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.3796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7004  membrane protein  82.67 
 
 		 151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.942159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5417  membrane protein  78.85 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.711209  normal  0.0915439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5486  membrane protein of uknown function UCP014873  29.53 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648729  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1480  hypothetical protein  28.97 
 
 		 301 aa  50.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0592  hypothetical protein  40.58 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2386  hypothetical protein  31.09 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0847  membrane protein-like  34.25 
 
 		 255 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6898  hypothetical protein  26.85 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0336  hypothetical protein  27.5 
 
 		 177 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0308  hypothetical protein  27.5 
 
 		 177 aa  40.8  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>