2504 genes were found for organism Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 26    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Bcen_2986  CDS  NC_008061  19  1329  1311  cytochrome c, class I  YP_622855  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_2987  CDS  NC_008061  1641  2561  921  LysR family transcriptional regulator  YP_622856  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_2988  CDS  NC_008061  2671  3408  738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_622857  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_2989  CDS  NC_008061  3465  4547  1083  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  YP_622858  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_2990  CDS  NC_008061  4709  5545  837  alpha/beta hydrolase fold  YP_622859  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_2991  CDS  NC_008061  5622  6011  390  limonene-1,2-epoxide hydrolase  YP_622860  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_2992  CDS  NC_008061  6210  7409  1200  peptidase M20D, amidohydrolase  YP_622861  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_2993  CDS  NC_008061  7466  8797  1332  major facilitator transporter  YP_622862  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_2994  CDS  NC_008061  8816  9736  921  LysR family transcriptional regulator  YP_622863  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_2995  CDS  NC_008061  9873  10646  774  extracellular solute-binding protein  YP_622864  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_2996  CDS  NC_008061  10702  11817  1116  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  YP_622865  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_2997  CDS  NC_008061  12028  12855  828  IclR family transcriptional regulator  YP_622866  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_2998  CDS  NC_008061  13044  14246  1203  beta-ketoadipyl CoA thiolase  YP_622867  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_2999  CDS  NC_008061  14347  14943  597  hypothetical protein  YP_622868  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3000  CDS  NC_008061  14959  15519  561  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_622869  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3001  CDS  NC_008061  15516  16373  858  methyltransferase type 11  YP_622870  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3002  CDS  NC_008061  16685  18229  1545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  YP_622871  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3003  CDS  NC_008061  18578  20185  1608  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  YP_622872  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3004  CDS  NC_008061  20300  21769  1470  succinic semialdehyde dehydrogenase  YP_622873  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3005  CDS  NC_008061  21861  23150  1290  4-aminobutyrate aminotransferase  YP_622874  normal  0.742708  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3006  CDS  NC_008061  23271  24779  1509  GntR family transcriptional regulator  YP_622875  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3007  CDS  NC_008061  25049  25885  837  hypothetical protein  YP_622876  normal  0.558663  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3008  CDS  NC_008061  25989  27062  1074  selenophosphate synthetase  YP_622877  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3009  CDS  NC_008061  27135  27728  594  lysine exporter protein LysE/YggA  YP_622878  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3010  CDS  NC_008061  27957  29036  1080  purine nucleoside permease  YP_622879  normal  0.435563  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3011  CDS  NC_008061  29264  29557  294  hypothetical protein  YP_622880  normal  0.203894  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3012  CDS  NC_008061  29966  30970  1005  LysR family transcriptional regulator  YP_622881  normal  0.0225148  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3013  CDS  NC_008061  31064  32005  942  Alpha/beta hydrolase fold-3  YP_622882  normal  0.325017  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3014  CDS  NC_008061  32044  33261  1218  secretion protein HlyD  YP_622883  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3015  CDS  NC_008061  33307  36492  3186  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  YP_622884  normal  0.841089  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3016  CDS  NC_008061  36503  38044  1542  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  YP_622885  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3017  CDS  NC_008061  38431  38844  414  hypothetical protein  YP_622886  normal  0.328214  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3018  CDS  NC_008061  39037  39927  891  LysR family transcriptional regulator  YP_622887  normal  0.402662  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3019  CDS  NC_008061  40029  40469  441  transmembrane pair  YP_622888  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3020  CDS  NC_008061  40572  41423  852  alpha/beta hydrolase fold  YP_622889  normal  0.702014  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3021  CDS  NC_008061  41753  42889  1137  hypothetical protein  YP_622890  normal  0.768309  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3022  CDS  NC_008061  42895  43731  837  hypothetical protein  YP_622891  normal  0.689428  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3023  CDS  NC_008061  43754  44083  330  hypothetical protein  YP_622892  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3024  CDS  NC_008061  44109  45470  1362  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  YP_622893  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3025  CDS  NC_008061  45460  47364  1905  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  YP_622894  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3026  CDS  NC_008061  47514  48923  1410  citrate carrier protein  YP_622895  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3027  CDS  NC_008061  49314  50087  774  NLPA lipoprotein  YP_622896  normal  0.15305  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3028  CDS  NC_008061  50164  51576  1413  flavin-dependent oxidoreductase  YP_622897  normal  0.0660648  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3029  CDS  NC_008061  51595  52779  1185  ABC transporter related  YP_622898  normal  0.193089  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3030  CDS  NC_008061  52772  53428  657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_622899  normal  0.233066  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3031  CDS  NC_008061  53480  54322  843  hypothetical protein  YP_622900  normal  0.0826456  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3032  CDS  NC_008061  54319  55530  1212  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  YP_622901  normal  0.210165  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3033  CDS  NC_008061  55547  56356  810  hypothetical protein  YP_622902  normal  0.0922244  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3034  CDS  NC_008061  56463  57734  1272  cobalamin synthesis protein, P47K  YP_622903  normal  0.0820283  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3035  CDS  NC_008061  57763  58713  951  putative GTP cyclohydrolase  YP_622904  normal  0.072271  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3036  CDS  NC_008061  58707  59285  579  6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase-like  YP_622905  normal  0.0497044  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3037  CDS  NC_008061  59285  59845  561  carbonic anhydrase  YP_622906  normal  0.0153015  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3038  CDS  NC_008061  59849  61219  1371  dihydroorotase  YP_622907  normal  0.0322135  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3039  CDS  NC_008061  61216  61680  465  AsnC family transcriptional regulator  YP_622908  normal  0.0212716  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3040  CDS  NC_008061  61849  62475  627  lysine exporter protein LysE/YggA  YP_622909  normal  0.408857  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3041  CDS  NC_008061  62508  63356  849  XRE family transcriptional regulator  YP_622910  normal  0.620788  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3042  CDS  NC_008061  63494  64513  1020  uncharacterized membrane-anchored protein  YP_622911  normal  0.456464  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3043  CDS  NC_008061  64510  65235  726  peptidase M50  YP_622912  normal  0.216443  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3044  CDS  NC_008061  65302  66696  1395  D-galactonate transporter  YP_622913  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3045  CDS  NC_008061  66944  68521  1578  aldehyde dehydrogenase  YP_622914  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3046  CDS  NC_008061  68649  69020  372  PilT protein-like  YP_622915  normal  0.454539  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3047  CDS  NC_008061  69017  69214  198  hypothetical protein  YP_622916  normal  0.251694  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3048  CDS  NC_008061  69400  69954  555  hypothetical protein  YP_622917  normal  0.645788  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3049  CDS  NC_008061  70069  70983  915  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  YP_622918  normal  0.62883  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3050  CDS  NC_008061  71213  72766  1554  galactarate dehydratase  YP_622919  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3051  CDS  NC_008061  72852  73334  483  AsnC family transcriptional regulator  YP_622920  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3052  CDS  NC_008061  73461  74591  1131  extracellular ligand-binding receptor  YP_622921  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3053  CDS  NC_008061  74588  76078  1491  aminotransferase, class IV  YP_622922  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3054  CDS  NC_008061  76213  76605  393  hypothetical protein  YP_622923  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3055  CDS  NC_008061  76618  77139  522  RbsD or FucU transport  YP_622924  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3056  CDS  NC_008061  77327  77764  438  DoxX  YP_622925  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3057  CDS  NC_008061  77868  79244  1377  major facilitator transporter  YP_622926  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3058  CDS  NC_008061  79500  80678  1179  extracellular ligand-binding receptor  YP_622927  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3059  CDS  NC_008061  80862  81113  252  hypothetical protein  YP_622928  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3060  CDS  NC_008061  81256  82050  795  AraC family transcriptional regulator  YP_622929  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3061  CDS  NC_008061  82136  82399  264  hypothetical protein  YP_622930  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3062  CDS  NC_008061  82682  84574  1893  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  YP_622931  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3063  CDS  NC_008061  84832  85287  456  3-dehydroquinate dehydratase  YP_622932  normal  0.816098  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3064  CDS  NC_008061  85284  86138  855  shikimate 5-dehydrogenase  YP_622933  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3065  CDS  NC_008061  86172  87515  1344  major facilitator transporter  YP_622934  normal  0.347514  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3066  CDS  NC_008061  87619  88728  1110  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  YP_622935  normal  0.779226  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3067  CDS  NC_008061  88989  90080  1092  ABC transporter periplasmic-binding protein  YP_622936  normal  0.127261  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3068  CDS  NC_008061  90115  91218  1104  ABC transporter related  YP_622937  normal  0.128785  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3069  CDS  NC_008061  91238  92116  879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_622938  normal  0.0268299  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3070  CDS  NC_008061  92106  92966  861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_622939  hitchhiker  0.00666197  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3071  CDS  NC_008061  92963  94273  1311  phosphonoacetate hydrolase  YP_622940  hitchhiker  0.000656592  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3072  CDS  NC_008061  94273  95724  1452  aldehyde dehydrogenase  YP_622941  hitchhiker  9.76863e-08  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3073  CDS  NC_008061  95729  96283  555  HD phosphohydrolase-like  YP_622942  hitchhiker  1.21385e-09  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3074  CDS  NC_008061  102612  104036  1425  major facilitator transporter  YP_622943  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3075  CDS  NC_008061  104290  105051  762  hypothetical protein  YP_622944  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3076  CDS  NC_008061  105370  106962  1593  phosphate transporter  YP_622945  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3077  CDS  NC_008061  107127  107717  591  phosphoglycerate mutase  YP_622946  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3078  CDS  NC_008061  107940  108149  210  hypothetical protein  YP_622947  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3079  CDS  NC_008061  108163  108885  723  hypothetical protein  YP_622948  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3080  CDS  NC_008061  108909  109817  909  LysR family transcriptional regulator  YP_622949  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3081  CDS  NC_008061  109945  112239  2295  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine S-methyltransferase  YP_622950  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3082  CDS  NC_008061  112368  113693  1326  major facilitator transporter  YP_622951  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3083  CDS  NC_008061  113749  114813  1065  agmatinase, putative  YP_622952  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3084  CDS  NC_008061  114840  115757  918  LysR family transcriptional regulator  YP_622953  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3085  CDS  NC_008061  115821  116285  465  AsnC family transcriptional regulator  YP_622954  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 26    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>