52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3023 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5343  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  223  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.740309  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4925  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  223  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3023  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  223  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5222  hypothetical protein  89.91 
 
 		 109 aa  205  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0305  hypothetical protein  88.07 
 
 		 121 aa  202  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3387  hypothetical protein  87.16 
 
 		 109 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4693  hypothetical protein  84.07 
 
 		 113 aa  192  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.153331 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3571  hypothetical protein  46.43 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.985911  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3010  hypothetical protein  46.34 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0676  hypothetical protein  44.71 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2511  hypothetical protein  44.71 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0125  hypothetical protein  44.71 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0918  hypothetical protein  44.71 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.62062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0922  hypothetical protein  44.71 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0376  hypothetical protein  44.71 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1074  hypothetical protein  44.71 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0733  hypothetical protein  43.53 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1165  hypothetical protein  46.43 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.659614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2764  hypothetical protein  43.37 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0744  hypothetical protein  44.71 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.437314 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2555  hypothetical protein  45.12 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.132154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0530  hypothetical protein  41.18 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1453  hypothetical protein  45.24 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0521  hypothetical protein  43.9 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2180  hypothetical protein  44.05 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444997  normal  0.720389 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2831  hypothetical protein  43.9 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511648  normal  0.844244 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2425  hypothetical protein  43.9 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3204  hypothetical protein  42.53 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0758  hypothetical protein  42.53 
 
 		 113 aa  67  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3001  hypothetical protein  44.05 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2428  hypothetical protein  44.05 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2903  hypothetical protein  41.57 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.530714  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0905  hypothetical protein  42.22 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2552  hypothetical protein  41.67 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2471  hypothetical protein  41.67 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0130577 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2576  hypothetical protein  41.67 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944303 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1940  hypothetical protein  41.67 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5884  hypothetical protein  42.05 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1470  hypothetical protein  38.71 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3034  hypothetical protein  40.96 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.233347  normal  0.328557 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3028  hypothetical protein  41.38 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1755  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.161099  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2677  hypothetical protein  36 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.913736  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1853  hypothetical protein  35.63 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2012  acetyltransferase  32.53 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0182  hypothetical protein  32.53 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2286  hypothetical protein  35.87 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.583133  normal  0.55869 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0538  hypothetical protein  35.71 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0514  hypothetical protein  35.71 
 
 		 98 aa  57  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1392  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0103  hypothetical protein  34.04 
 
 		 180 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.844457  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1914  hypothetical protein  32.18 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>