44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3079 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5288  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3079  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4980  hypothetical protein  99.17 
 
 
240 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4648  hypothetical protein  87.5 
 
 
239 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0360  hypothetical protein  91.25 
 
 
240 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171003  normal  0.610905 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5177  hypothetical protein  89.17 
 
 
240 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.237679 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2600  hypothetical protein  80.6 
 
 
246 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000803588  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6611  hypothetical protein  74.38 
 
 
246 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27384  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5086  hypothetical protein  74.15 
 
 
255 aa  348  5e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0755005  normal  0.0704408 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3436  hypothetical protein  66.67 
 
 
255 aa  299  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3463  hypothetical protein  56.03 
 
 
252 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3173  hypothetical protein  55.41 
 
 
248 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.380855 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3023  hypothetical protein  47.77 
 
 
263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2503  hypothetical protein  51.69 
 
 
238 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.155963 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3464  hypothetical protein  55.42 
 
 
248 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2249  hypothetical protein  49.34 
 
 
252 aa  199  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4865  hypothetical protein  50.21 
 
 
266 aa  178  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.04962  normal  0.390443 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3242  hypothetical protein  45.71 
 
 
265 aa  175  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766904  normal  0.363076 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1543  hypothetical protein  45.15 
 
 
248 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0856493  normal  0.144706 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0164  hypothetical protein  44.21 
 
 
263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5841  hypothetical protein  37.59 
 
 
289 aa  161  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.322989  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5403  hypothetical protein  37.94 
 
 
263 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1432  hypothetical protein  39.16 
 
 
268 aa  153  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.762599  normal  0.87586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5887  hypothetical protein  40.82 
 
 
249 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2803  hypothetical protein  38.24 
 
 
265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5355  hypothetical protein  38.08 
 
 
266 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5353  hypothetical protein  37.34 
 
 
304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2488  hypothetical protein  40.87 
 
 
259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378044 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5656  hypothetical protein  36.32 
 
 
257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5140  hypothetical protein  34.75 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4840  hypothetical protein  34.32 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4754  hypothetical protein  34.32 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290335  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2882  hypothetical protein  35.2 
 
 
293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1804  hypothetical protein  34.13 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0019  hypothetical protein  36.53 
 
 
250 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0308  hypothetical protein  37.67 
 
 
264 aa  99.4  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0645  hypothetical protein  33.49 
 
 
256 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420731  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0069  hypothetical protein  54.65 
 
 
141 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0086  hypothetical protein  54.65 
 
 
141 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0070  hypothetical protein  53.49 
 
 
172 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1497  hypothetical protein  53.49 
 
 
164 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1214  ABC transporter, permease protein  53.49 
 
 
141 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0878  hypothetical protein  32.76 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312149 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0633  hypothetical protein  31.02 
 
 
224 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>