49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3242 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3242  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  510  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766904  normal  0.363076 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3173  hypothetical protein  49.38 
 
 		 248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.380855 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0164  hypothetical protein  48.99 
 
 		 263 aa  209  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3023  hypothetical protein  45.14 
 
 		 263 aa  209  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2600  hypothetical protein  44.53 
 
 		 246 aa  208  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000803588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3463  hypothetical protein  48.97 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6611  hypothetical protein  44.21 
 
 		 246 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3436  hypothetical protein  46.31 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5086  hypothetical protein  46.06 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0755005  normal  0.0704408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3464  hypothetical protein  48.13 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4648  hypothetical protein  43.85 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0360  hypothetical protein  45.34 
 
 		 240 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171003  normal  0.610905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2503  hypothetical protein  45.27 
 
 		 238 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.155963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5887  hypothetical protein  45.34 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4980  hypothetical protein  46.77 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5288  hypothetical protein  46.77 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3079  hypothetical protein  46.77 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2249  hypothetical protein  45.38 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5177  hypothetical protein  43.85 
 
 		 240 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.237679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5841  hypothetical protein  39.11 
 
 		 289 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.322989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1543  hypothetical protein  41.3 
 
 		 248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0856493  normal  0.144706 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5403  hypothetical protein  38.74 
 
 		 263 aa  164  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36525 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4865  hypothetical protein  45.95 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.04962  normal  0.390443 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1432  hypothetical protein  39.63 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.762599  normal  0.87586 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2488  hypothetical protein  42.8 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378044 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2882  hypothetical protein  40.7 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5140  hypothetical protein  40.59 
 
 		 265 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5656  hypothetical protein  38.63 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5355  hypothetical protein  37.59 
 
 		 266 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2803  hypothetical protein  37.94 
 
 		 265 aa  145  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5353  hypothetical protein  36.05 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4754  hypothetical protein  38.4 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4840  hypothetical protein  38.4 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1804  hypothetical protein  32.67 
 
 		 275 aa  128  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0645  hypothetical protein  35.32 
 
 		 256 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420731  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0019  hypothetical protein  36.28 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0308  hypothetical protein  36.89 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0633  hypothetical protein  31.11 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0878  hypothetical protein  26.36 
 
 		 242 aa  72  0.000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312149 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0086  hypothetical protein  41.43 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1497  hypothetical protein  41.43 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1214  ABC transporter, permease protein  41.43 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0069  hypothetical protein  41.43 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0070  hypothetical protein  41.43 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3152  hypothetical protein  27.46 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00956789  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2354  cobalt transporter, subunit CbtA  28.33 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2215  hypothetical protein  28.82 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2777  cobalt transporter, subunit CbtA  28.39 
 
 		 236 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0561965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2532  cobalt transporter, subunit CbtA  29.87 
 
 		 228 aa  42  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>