31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3152 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3152  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00956789  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3018  hypothetical protein  90 
 
 		 240 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.960935  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3101  cobalt transporter subunit CbtA, putative  76.96 
 
 		 233 aa  327  7e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2354  cobalt transporter, subunit CbtA  75.65 
 
 		 228 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2532  cobalt transporter, subunit CbtA  74.24 
 
 		 228 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2777  cobalt transporter, subunit CbtA  72.65 
 
 		 236 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0561965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2215  hypothetical protein  71.91 
 
 		 233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25940  hypothetical protein  73.11 
 
 		 364 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00053463  normal  0.0606013 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6984  cobalt transporter, subunit CbtA  42.5 
 
 		 241 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4714  cobalt transporter, subunit CbtA  42.5 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2301  hypothetical protein  52.84 
 
 		 181 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.395641  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3775  cobalt transporter, subunit CbtA  43.89 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.461264  normal  0.391945 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2525  cobalt transporter, subunit CbtA  35.9 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1309  hypothetical protein  43.35 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.236923  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1272  hypothetical protein  42.86 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1874  cobalt transporter, subunit CbtA  42.5 
 
 		 237 aa  118  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.245777  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1440  cobalt transporter, subunit CbtA  38.61 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.473555 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2222  cobalt transporter subunit CbtA, putative  35.02 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.338771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1443  cobalt transporter, subunit CbtA  38.67 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.376445 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1718  cobalt transporter, subunit CbtA  38.67 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  0.0137404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3112  cobalt transporter, subunit CbtA  41.47 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0398133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2434  cobalt transporter, subunit CbtA  40.09 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.189525 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0161  possible cobalt transporter, subunit CbtA  34.91 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.528614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2146  cobalt transporter, subunit CbtA  36.44 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738825  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2768  hypothetical protein  32.93 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.319102  normal  0.0713993 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2154  hypothetical protein  31.73 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0542665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1015  hypothetical protein  31.25 
 
 		 263 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0481  hypothetical protein  31.25 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.844634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0446  hypothetical protein  31.25 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0964398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5355  hypothetical protein  26.46 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6611  hypothetical protein  28.63 
 
 		 246 aa  42  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27384  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>