44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2249 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2249  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  477  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6611  hypothetical protein  51.75 
 
 		 246 aa  234  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2600  hypothetical protein  51.75 
 
 		 246 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000803588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5086  hypothetical protein  49.18 
 
 		 255 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0755005  normal  0.0704408 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3463  hypothetical protein  50.44 
 
 		 252 aa  215  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3436  hypothetical protein  46.81 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4648  hypothetical protein  49.12 
 
 		 239 aa  205  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3173  hypothetical protein  50 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.380855 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4980  hypothetical protein  48.9 
 
 		 240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3079  hypothetical protein  49.34 
 
 		 240 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5288  hypothetical protein  49.34 
 
 		 240 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0360  hypothetical protein  47.58 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171003  normal  0.610905 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5177  hypothetical protein  49.56 
 
 		 240 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.237679 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3023  hypothetical protein  45.38 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3464  hypothetical protein  53.71 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0164  hypothetical protein  46.15 
 
 		 263 aa  178  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3242  hypothetical protein  45.38 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766904  normal  0.363076 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2503  hypothetical protein  47.72 
 
 		 238 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.155963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4865  hypothetical protein  49.35 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.04962  normal  0.390443 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1543  hypothetical protein  38.98 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0856493  normal  0.144706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5841  hypothetical protein  38.49 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.322989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5403  hypothetical protein  38.98 
 
 		 263 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5887  hypothetical protein  42.32 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1432  hypothetical protein  37.84 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.762599  normal  0.87586 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2488  hypothetical protein  40.3 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378044 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2882  hypothetical protein  39.08 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2803  hypothetical protein  38.19 
 
 		 265 aa  132  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5140  hypothetical protein  36.51 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5656  hypothetical protein  38.72 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5353  hypothetical protein  35.93 
 
 		 304 aa  122  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4754  hypothetical protein  36.1 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290335  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5355  hypothetical protein  35.94 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4840  hypothetical protein  36.1 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1804  hypothetical protein  33.97 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0019  hypothetical protein  38.01 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0645  hypothetical protein  35.58 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420731  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0633  hypothetical protein  37.16 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0308  hypothetical protein  37.79 
 
 		 264 aa  92  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0878  hypothetical protein  29.06 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312149 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1497  hypothetical protein  43.82 
 
 		 164 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0070  hypothetical protein  43.82 
 
 		 172 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1214  ABC transporter, permease protein  43.9 
 
 		 141 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0086  hypothetical protein  45.12 
 
 		 141 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0069  hypothetical protein  43.9 
 
 		 141 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>