44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3173 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3173  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.380855 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3464  hypothetical protein  89.11 
 
 
248 aa  354  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2600  hypothetical protein  56.28 
 
 
246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000803588  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3436  hypothetical protein  54.76 
 
 
255 aa  265  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3463  hypothetical protein  60.17 
 
 
252 aa  265  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5086  hypothetical protein  56.22 
 
 
255 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0755005  normal  0.0704408 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6611  hypothetical protein  53.11 
 
 
246 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27384  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4648  hypothetical protein  56.28 
 
 
239 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3023  hypothetical protein  51.89 
 
 
263 aa  242  5e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5177  hypothetical protein  57.14 
 
 
240 aa  240  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.237679 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3079  hypothetical protein  55.41 
 
 
240 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5288  hypothetical protein  55.41 
 
 
240 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4980  hypothetical protein  54.98 
 
 
240 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0360  hypothetical protein  55.84 
 
 
240 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171003  normal  0.610905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2503  hypothetical protein  52.14 
 
 
238 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.155963 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2249  hypothetical protein  50 
 
 
252 aa  209  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3242  hypothetical protein  49.79 
 
 
265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766904  normal  0.363076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4865  hypothetical protein  51.69 
 
 
266 aa  182  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.04962  normal  0.390443 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0164  hypothetical protein  45.64 
 
 
263 aa  179  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1543  hypothetical protein  42.92 
 
 
248 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0856493  normal  0.144706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5841  hypothetical protein  33.83 
 
 
289 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.322989  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5887  hypothetical protein  41.04 
 
 
249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1432  hypothetical protein  36.9 
 
 
268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.762599  normal  0.87586 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5403  hypothetical protein  38.02 
 
 
263 aa  155  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36525 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5140  hypothetical protein  39.75 
 
 
265 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2488  hypothetical protein  44.76 
 
 
259 aa  149  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2803  hypothetical protein  39.91 
 
 
265 aa  141  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4754  hypothetical protein  39.33 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4840  hypothetical protein  39.33 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5355  hypothetical protein  37.69 
 
 
266 aa  138  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5656  hypothetical protein  38.46 
 
 
257 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2882  hypothetical protein  36.12 
 
 
293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5353  hypothetical protein  36.03 
 
 
304 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1804  hypothetical protein  35.43 
 
 
275 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0645  hypothetical protein  35.55 
 
 
256 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420731  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0019  hypothetical protein  32.23 
 
 
250 aa  99.4  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0308  hypothetical protein  41.98 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0878  hypothetical protein  27.46 
 
 
242 aa  86.3  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312149 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0633  hypothetical protein  38.22 
 
 
224 aa  79  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1214  ABC transporter, permease protein  35.53 
 
 
141 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1497  hypothetical protein  35.53 
 
 
164 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0086  hypothetical protein  40 
 
 
141 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0070  hypothetical protein  35.53 
 
 
172 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0069  hypothetical protein  35.53 
 
 
141 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>